大鼠肝再生中高表達lncRNA調(diào)節(jié)肝細胞增殖的途徑和方式研究.pdf

1、本研究采用高通量測序方法檢測大鼠2/3肝切除誘導的肝再生10個時間點肝細胞中表達的lncRNA，根據(jù)表達豐度篩選出高表達lncRNA。結(jié)果表明，大鼠肝再生10個時間點肝細胞中共表達11389個lncRNA，其中，130個lncRNA的表達豐度在100以上，為高表達lncRNA。
　　為了解這些高表達lncRNA對肝再生的調(diào)節(jié)作用，采用生物信息學方法預測其靶基因，結(jié)果表明，130個高表達lncRNA有1314個靶基因。從靶基因角度出

2、發(fā)，為進一步篩選出待研究的lncRNA及其在肝再生中的作用，用Rat Genome2302.0基因芯片檢測上述1314個高表達lncRNA靶基因在大鼠肝再生10個時間點肝細胞中的表達譜。結(jié)果表明，有751個靶基因被檢測到，其中243個發(fā)生了有意義表達變化，包括175個有意義上調(diào)靶基因，66個有意義下調(diào)靶基因，2個上/下調(diào)靶基因。分析這243個高表達lncRNA有意義靶基因參與的生理活動表明，其中238個靶基因功能已知，主要參與應激反應、

3、發(fā)育過程、細胞通訊、信號傳導、核酸代謝、器官發(fā)育、分子運輸、細胞增殖和細胞分化等生理活動，其中，參與細胞增殖的有意義靶基因有68個。
　　本文選取細胞增殖活動進一步研究高表達lncRNA通過其有意義靶基因調(diào)節(jié)肝再生的途徑和方式。根據(jù)本研究組已建立的方法確認上述243個高表達lncRNA有意義靶基因參與的信號通路，結(jié)果表明，它們共參與15條細胞增殖相關信號通路。用譜函數(shù)Ep(t)分析這些信號通路的信號傳導活動表明，其中的6條通路在肝

4、再生的起始和/或進展階段被激活，分別為Growth Hormone通路、NF-κB通路、PI3K/AKT通路、HGF通路、IL-6通路和cAMP通路。進一步分析上述68個細胞增殖靶基因的協(xié)同作用表明，它們所支配的細胞增殖活動在肝再生的進展階段被激活，說明高表達lncRNA有意義靶基因所支配的細胞增殖信號通路的信號傳導活動與高表達lncRNA有意義靶基因所支配的細胞增殖活動呈正相關。
　　以上結(jié)果說明，由高表達lncRNA有意義靶基