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1、轉(zhuǎn)錄因子(Transcription factor,TFs)通常也也稱為反式作用因子,能夠與基因啟動(dòng)子區(qū)域的順式作用元件特異性結(jié)合,激活或抑制下游基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá),從而達(dá)到調(diào)控基因表達(dá)的目的。
GRAS蛋白家族作為高等植物特有的轉(zhuǎn)錄因子,據(jù)報(bào)道在赤霉素信號(hào)通路、分生組織的維持和光敏色素信號(hào)通路等重要的生理過程以及植物抗逆過程中發(fā)揮重要的生理功能。該蛋白家族通常由400-770個(gè)氨基酸組成,羧基端高度保守,氨基端在序列長(zhǎng)度和種類上
2、復(fù)雜多變,同時(shí)決定著蛋白獨(dú)有的功能。迄今為止,大部分GRAS蛋白家族成員的功能尚未報(bào)道。
本研究以番茄(Solanum lycopersicum)為材料,對(duì)GRAS家族成員SlGRAS1進(jìn)行研究。首先從番茄基因組中克隆了SlGRAS1基因,分析了基因結(jié)構(gòu)、啟動(dòng)子區(qū)域以及蛋白物理性質(zhì)和結(jié)構(gòu)特征,構(gòu)建了GRAS蛋白家族的系統(tǒng)發(fā)生樹;采用Real-time PCR方法研究了番茄SlGRAS1基因的時(shí)空表達(dá)模式以及非生物脅迫、外源激素
3、的響應(yīng)情況;構(gòu)建了超表達(dá)載體和反義表達(dá)載體,通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)番茄的遺傳轉(zhuǎn)化,獲得了相應(yīng)的轉(zhuǎn)基因植株,并進(jìn)行形態(tài)學(xué)觀察分析以及與成熟相關(guān)基因的表達(dá)量檢測(cè)。初步分析了番茄SlGRAS1基因在番茄生長(zhǎng)發(fā)育過程中的生物學(xué)功能。本研究得到的主要結(jié)果如下:
一、運(yùn)用生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),番茄SlGRAS1基因全長(zhǎng)1629bp,編碼542個(gè)氨基酸,具有典型的GRAS家族特征;啟動(dòng)子區(qū)域分析發(fā)現(xiàn),該區(qū)域具有許多功能元件,如光應(yīng)答元件、逆境應(yīng)答元件
4、和激素應(yīng)答元件。
二、蛋白預(yù)測(cè)分析發(fā)現(xiàn)SlGRAS1蛋白的分子量和等電點(diǎn)分別為60.5KDa和5.52,預(yù)測(cè)可能為不穩(wěn)定的脂溶性親水蛋白,無信號(hào)肽和跨膜區(qū)域,因此不是分泌蛋白和膜蛋白。根據(jù)系統(tǒng)發(fā)生樹分析,SlGRAS1屬于PAT1亞家族,與AtSCL13具有83%的氨基酸序列相似性。
三、該基因的組織特異性表達(dá)分析發(fā)現(xiàn),番茄SlGRAS1基因在花和莖中表達(dá)量較高,在果實(shí)坐果到成熟過程中,SlGRAS1基因在坐果和破色
5、期表達(dá)量明顯高于其他時(shí)期。逆境脅迫響應(yīng)中,低溫和高溫處理對(duì)SlGRAS1基因的表達(dá)影響較大,氧脅迫、滲透壓脅迫和鹽脅迫對(duì)基因表達(dá)影響相對(duì)較小。外源激素響應(yīng)分析顯示,SlGRAS1基因的表達(dá)在轉(zhuǎn)錄水平上受到這些激素的調(diào)控,其中外源施加生長(zhǎng)素(Indole-3-acetic acid,IAA)和乙烯使得SlGRAS1基因的表達(dá)水平顯著上調(diào)。
四、構(gòu)建超表達(dá)載體K303-35S-SlGRAS1-GFP和干擾抑制載體pCambia13
6、01-AsSlGRAS1,并通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)入番茄中獲得了超表達(dá)陽性植株,以野生型為對(duì)照,我們通過對(duì)T1代和T2代超表達(dá)轉(zhuǎn)基因植株進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)分析,發(fā)現(xiàn)SlGRAS1超表達(dá)植株具有株高變高,節(jié)間距伸長(zhǎng)以及果實(shí)成熟推遲的表型。
五、對(duì)果實(shí)成熟周期延長(zhǎng)的現(xiàn)象研究中,我們選取了超表達(dá)轉(zhuǎn)基因植株四個(gè)不同發(fā)育時(shí)期MG,Br,Br+4,Br+7的果實(shí),提取RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA,同時(shí)篩選了與成熟相關(guān)的重要的基因,通過Real-time PC
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