四川省PCV2分離株全基因組序列的克隆與進(jìn)化分析.pdf

1、豬圓環(huán)病毒Ⅱ型(Porcine circovirus type2，PCV2)是20世紀(jì)末期新發(fā)現(xiàn)的一種豬病病原。由于斷奶仔豬多系統(tǒng)衰竭綜合征(PMWS)、斷奶仔豬拉稀、斷奶仔豬和育肥豬的呼吸道疾病(PRDS)、幼齡仔豬A2型先天性震顫(CT)、增生性壞死性肺炎(PNP)和間質(zhì)性肺炎(IP)、豬皮炎和腎炎綜合征(PDNS)以及懷孕母豬繁殖障礙(SAMS)等疾病均與PCV2的關(guān)系較為密切，因此這類疾病被統(tǒng)稱PCV2感染或豬圓環(huán)病毒病(PCV

2、D)或豬圓環(huán)病毒相關(guān)病(PCVAD)。自1991年P(guān)CV2被首次報(bào)道以來(lái)，該病毒已在世界許多國(guó)家和地區(qū)發(fā)生流行，造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失，嚴(yán)重威脅著世界養(yǎng)豬業(yè)的健康發(fā)展。PCV2感染的防控研究一直是國(guó)內(nèi)外的重要研究課題，為了解四川省豬群中PCV2的流行及遺傳變異情況，本研究根據(jù)GenBank公布的PCV2全基因組序列設(shè)計(jì)合成2對(duì)特異性引物，并對(duì)不同地方送檢樣品中分離到PCV2毒株的全基因組進(jìn)行了擴(kuò)增、純化回收、連接轉(zhuǎn)化、測(cè)序鑒定和序列分析。

3、本研究共從臨床病料中分離得到3株P(guān)CV2毒株（PCV22012S1株、PCV22012S2株和PCV22013S1株），核苷酸序列分析結(jié)果表明這3株P(guān)CV2基因組全長(zhǎng)均為1767 bp;3株P(guān)CV2分離株的全基因組核苷酸同源性為99.5％-99.9％，差異性0.1％-0.5％，其中ORF1核苷酸同源性99.8％-99.9％，差異性0.1％-0.2％，ORF2核苷酸同源性分別為99.4％-100％，差異性分別為0％-0.6％;氨基酸序列比

4、對(duì)結(jié)果表明3株P(guān)CV2的ORF1氨基酸同源性為99.4％-99.9％，差異性為0.3％-0.6％，ORF2氨基酸同源性分別為99.6％，差異性為0;遺傳進(jìn)化分析結(jié)果表明本研究中的3株P(guān)CV2與國(guó)內(nèi)外其它45株參考毒株序列相比存在一定的變異，該3株P(guān)CV2四川分離株僅與國(guó)內(nèi)早期分離的兩株P(guān)CV2和新加坡2007年分離的1株親緣關(guān)系較近，處在同一個(gè)分支，屬于較新的基因亞型PCV2c。本研究通過(guò)臨床樣品分離、鑒定、測(cè)序及分析等一系列方法對(duì)四川