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文檔簡介
1、山梨醇脫氫酶(sorbitol dehydrogenase,SDH)是山梨醇轉(zhuǎn)化為糖原的關(guān)鍵酶。家蠶有3個SDH基因,即BmSDH-1、BmSDH-2a和BmSDH-2b,均位于家蠶第21號染色體。家蠶卵中山梨醇含量的變化與卵期滯育的發(fā)動、持續(xù)和停止有著密切的平行關(guān)系。以往的研究集中于BmSDH在卵期的表達及酶活情況,對于家蠶其它時期和組織的表達的研究較少,也未見BmSDH啟動子特性分析。
本論文在生物信息學(xué)分析BmSDH-1
2、、BmSDH-2a和BmSDH-2b基因的結(jié)構(gòu)、同源性以及蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,用RT-PCR的方法分析了3個BmSDH基因的時空表達特性,比較了25℃明催青和17.5℃暗催青兩種不同催青條件對家蠶后期BmSDH表達的影響;克隆了BmSDH-2a啟動子片段,分析了其轉(zhuǎn)錄特性。
1. BmSDH的生物信息學(xué)分析
BmSDH-1基因全長6.035kb,由8個外顯子7個內(nèi)含子構(gòu)成;BmSDH-2a基因全長10.75kb,由6
3、個外顯子5個內(nèi)含子構(gòu)成;BmSDH-2b基因全長約10.15kb,由8個外顯子7個內(nèi)含子構(gòu)成。一級結(jié)構(gòu)分析顯示 BmSDH-1與 BmSDH-2a, BmSDH-2b之間的相似度均為49.7%,BmSDH-2a和 BmSDH-2b的相似度為96.4%。用MEGA4.0軟件構(gòu)建了BmSDH-1,-2a和-2b與其他13個物種(包括昆蟲、兩棲類、哺乳和人類)基于同源蛋白氨基酸序列的系統(tǒng)進化樹,結(jié)果顯示BmSDH-1獨立成一個亞支,BmSDH
4、-2a和-2b屬于同一個分支,它們與蜜蜂、熊蜂以及印度跳蟻等昆蟲的親緣關(guān)系較近。
2. BmSDH基因時空表達特性分析及不同催青條件對表達的影響
根據(jù)家蠶二化性品種子代滯育性受親代胚胎期催青條件調(diào)控的原理,即25℃明催青則子代卵滯育,而20℃以下低溫暗催青則子代卵為非滯育。以二化性品種“秋豐”越年活化卵為材料,采用蛾區(qū)半分法,分別用25℃明催青和17.5℃暗催青處理,孵化后25℃常規(guī)方法桑葉飼養(yǎng),羽化后同一處理內(nèi)的雌
5、雄蛾交配制種。利用半定量RT-PCR的方法,分析不同發(fā)育時期的雌性蠶體及不同組織中BmSDH轉(zhuǎn)錄水平,以及25℃明催青和17.5℃暗催青對BmSDH轉(zhuǎn)錄水平的影響。結(jié)果顯示BmSDH-1、BmSDH-2a和 BmSDH-2b在“秋豐”品種的各個發(fā)育階段均有表達;在幼蟲期5齡3 d,BmSDH-1在常溫明催青組脂肪體中轉(zhuǎn)錄水平較高,BmSDH-2a和BmSDH-2b在常溫明催青條件下的血液、脂肪體和卵巢中轉(zhuǎn)錄水平均高于低溫暗催青處理組;在
6、蛹期3 d,BmSDH-2a和BmSDH-2b在常溫明催青條件下血液和卵巢中的轉(zhuǎn)錄水平均低于低溫暗催青處理組;在次代卵產(chǎn)下后6~24 h期間,BmSDH-1的轉(zhuǎn)錄水平較低且沒有明顯變化;而BmSDH-2a和BmSDH-2b的轉(zhuǎn)錄水平逐漸升高,但是2個基因的轉(zhuǎn)錄水平在不同催青處理中未見明顯變化。說明BmSDH-1和蠶卵滯育與否沒有直接關(guān)系,而BmSDH-2a和BmSDH-2b與家蠶二化性品種卵滯育與否有重要的平行關(guān)系。
3. B
7、mSDH-2a基因啟動子的克隆和特性分析
根據(jù)家蠶基因組中BmSDH-2a基因上游啟動子區(qū)域的核苷酸序列,分別設(shè)計2個上游和1個下游引物,以5齡后部絲腺基因組DNA為模板,用PCR方法克隆BmSDH-2a基因上游674bp和355 bp的啟動子片段BmSDH-2aP-674、BmSDH-2aP-355。在線軟件預(yù)測分析顯示,克隆的674bp長度片段含有核心啟動子區(qū),其中包括 TATA-盒和 GC盒,以及一些與胚胎發(fā)育相關(guān)的轉(zhuǎn)錄
8、因子結(jié)合位點,如 GATA-1、HSF1、CREB、CdxA、cap和Oct-1等,其中后4個多次出現(xiàn)。以pGL3.0 basic為載體,螢火蟲熒光素酶基因luciferace(luc)為報告基因,分別構(gòu)建不同長度 BmSDH-2a啟動子控制的報告質(zhì)粒 pGL-BmSDH-2aP-674-luc, pGL-BmSDH-2aP-355-luc;分別轉(zhuǎn)染家蠶BmN細胞,以轉(zhuǎn)染pGL3.0 basic-luc的細胞為對照,72h后收集細胞,在
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