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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:矮小癥的基因檢測(cè)未在國(guó)內(nèi)臨床中廣泛開(kāi)展,很多單基因病尚未被診斷。且我國(guó)對(duì)矮小癥的單基因病背景缺乏大規(guī)模的人群研究。本研究應(yīng)用靶向基因捕獲聯(lián)合二代測(cè)序技術(shù)的方法對(duì)矮小癥患者進(jìn)行基因檢測(cè)和病因診斷,旨在探究中國(guó)人群中病理性矮小癥的單基因疾病譜,建立矮小癥基因檢測(cè)的方法并驗(yàn)證方法的有效性。
方法:對(duì)門(mén)診矮小患者進(jìn)行臨床評(píng)估和資料收集,納入68例病因不明或可能與單基因突變相關(guān)的矮小患者,對(duì)其進(jìn)行全血DNA提取,應(yīng)用定制基因芯片對(duì)
2、466個(gè)矮小相關(guān)基因的外顯子進(jìn)行捕獲和二代測(cè)序,對(duì)變異進(jìn)行篩選、解讀和驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)致病基因突變和明確病因診斷。
結(jié)果:68例矮小患者根據(jù)臨床診斷分為五類,包括生長(zhǎng)激素缺乏癥20例,甲狀腺功能減退癥8例,骨軟骨發(fā)育不良16例,綜合癥16例,特發(fā)性矮小癥8例。
1、總體檢出結(jié)果:經(jīng)變異檢測(cè)、篩選和解讀,在24例患者中檢出23個(gè)基因突變,可能為患者的遺傳病因,總檢出率為35.3%。其中包括10例骨軟骨發(fā)育不良、8例綜合征、4
3、例原發(fā)甲狀腺功能低下、1例生長(zhǎng)激素缺乏癥和1例特發(fā)性矮小癥。11個(gè)突變已經(jīng)文獻(xiàn)報(bào)道,12個(gè)突變未經(jīng)報(bào)道。
2、骨軟骨發(fā)育不良疾病檢測(cè)結(jié)果:變異檢出率為62.5%,包括2例FGFR突變、1例NPR2突變、2例COL2A1突變、3例FBN1突變、1例TRAPPC2突變和1例ARSE突變。其中6例有報(bào)道,4例未經(jīng)文獻(xiàn)報(bào)道。
3、綜合癥檢測(cè)結(jié)果:變異檢出率為50%,包括5例單核苷酸變異和3例拷貝數(shù)變異。其中3例有文獻(xiàn)報(bào)道,5
4、例無(wú)文獻(xiàn)報(bào)道。單核苷酸變異包括2例PTPN11突變、1例KRAS突變、1例NIPBL突變和1例PORCN突變??截悢?shù)變異分別為染色體17p13.3大片段雜合缺失、染色體4p16.3大片段雜合缺失和NFI基因2-15外顯子的雜合重復(fù)。
4、甲狀腺功能減退癥檢測(cè)結(jié)果:變異檢出率50%,包括2例NKX2-1突變、1例NKX2-5變和1例PAX8突變。3例突變有文獻(xiàn)報(bào)道,1例突變無(wú)報(bào)
5、生長(zhǎng)激素缺乏癥檢測(cè)結(jié)果:1例患者檢出
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