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文檔簡介
1、研究目的:
喉鱗狀細胞癌(喉鱗癌)頸淋巴結轉移的早期發(fā)現(xiàn)對喉鱗癌的治療及預后至關重要,而目前人們對于相關的分子機理及分子標志的認識尚有限。本研究應用基因芯片技術,研究喉鱗狀細胞癌隱匿性頸淋巴結轉移相關的microRNA(miRNA)表達譜,篩選cN0期隱匿性頸淋巴結轉移陽性的喉鱗癌及無轉移者癌組織中差異表達的miRNA,為深入理解喉鱗癌發(fā)生淋巴結轉移的分子機理,尋找相應的分子生物學標志提供理論基礎和研究依據(jù)。
研究方
2、法:
選取cN0期原發(fā)喉鱗狀細胞癌患者6例,其中3例術后病理證實伴有頸淋巴結轉移,3例無淋巴結轉移,手術切除新鮮癌組織及對應癌旁正常黏膜組織標本,Trizol mirVana?miRNA Isolation Kit試劑盒提取總RNA,經(jīng)Agilent Bioanalyzer2100電泳質檢達芯片雜交質控要求后,采用Agilent Human miRNA Microarray version2 Kit,P/N G4470B芯片進
3、行RNA樣品標記及雜交實驗,洗滌后的芯片經(jīng)Agilent芯片激光掃描儀掃描后采用Feature Extraction軟件提取數(shù)據(jù),GeneSpring軟件分析數(shù)據(jù),以t-test檢驗篩選在轉移組和無轉移組中差異表達的miRNA(以P值<0.05和FC值>2為條件)。
研究結果:
共有13個miRNA在隱匿性轉移性喉鱗狀細胞癌中存在差異表達,相對于無淋巴結轉移組,在有淋巴結轉移組中有6個表達顯著上調(diào)(FC>2,P<0.
4、05),包括:hsa-miR-5194,hsa-miR-1305,hsa-miR-6717-5p,hsa-miR-1260b,hsa-miR-6131,hsa-miR-1288,其中hsa-miR-1288上調(diào)3倍以上;而表達明顯下調(diào)(FC<0.5,log2<-1,P<0.05)的miRNA有7個,分別是:hsa-miR-31-3p,hsa-miR-144-5p,hsa-miR-4728-3p,hsa-miR-5196-5p,hsa-m
5、iR-149-5p,hsa-miR-486-5p,hsa-miR-4417。
研究結論:
基因芯片技術是一種快捷有效的高通量分析喉鱗狀細胞癌淋巴結轉移相關miRNA表達譜的檢測方法。通過miRNA芯片分析,初步建立起轉移性喉鱗狀細胞癌差異性miRNA表達譜,共有13個miRNA:相對于無淋巴結轉移組,6個miRNA在伴有頸淋巴結轉移的喉鱗狀細胞癌組織中表達水平顯著上調(diào),7個miRNA的表達水平顯著下調(diào)。這13個差異表
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