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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:利用基因芯片檢測(cè)賁門腺癌(gastric cardia adenocarcinoma, GCA)PLCE1(rs2274223)、C20orf54(rs13042395)等位基因表現(xiàn),探討PLCE1、C20orf54單核苷酸多態(tài)(single-nucleotide polymorphisms,SNPs)與GCA及其病理分級(jí)(histologic grade,G)的關(guān)系;利用半定量逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(reverse transcri
2、ption-polymerase chain reaction,RT-PCR)檢測(cè)60例同一個(gè)體GCA癌與癌旁組織C20orf54mRNA表達(dá)情況,聯(lián)合 TAQMAN技術(shù)檢測(cè)C20orf54(rs13042395)等位基因表現(xiàn),探討C20orf54mRNA癌與癌旁組織的表達(dá)差異及其與C20orf54(rs13042395)SNPs及GCA病理分級(jí)之間的關(guān)系。
方法:提取1519例GCA及正常對(duì)照組全血標(biāo)本DNA,其中GCA51
3、9例,高分化組(G1-2)198例,低分化組(G3)321例,對(duì)照組1000例,采用Illumina610-Quad芯片進(jìn)行PLCE1(rs2274223)、C20orf54(rs13042395)位點(diǎn)掃描;利用 SPSS11.0軟件χ2檢驗(yàn)分析PLCE1(rs2274223)等位基因 G(基因型A/G+G/G)、C20orf54(rs13042395)等位基因C(基因型 T/C+C/C)的發(fā)生頻率與GCA及病理分級(jí)之間的關(guān)系;采用半定
4、量 RT-PCR方法對(duì)60例同一個(gè)體 GCA術(shù)后癌及癌旁新鮮組織進(jìn)行 C20orf54mRNA表達(dá)檢測(cè),同時(shí)提取全血標(biāo)本DNA,采用 TAQMAN技術(shù)檢測(cè) C20orf54(rs13042395)等位基因表現(xiàn),根據(jù)癌組織mRNA表達(dá)中位數(shù)分為高表達(dá)組(30例)和低表達(dá)組(30例);利用SPSS11.0軟件 t檢驗(yàn)及χ2檢驗(yàn)分析 C20orf54mRNA在癌與癌旁組織的表達(dá)差異及其與C20orf54(rs13042395)SNPs及GCA
5、病理分級(jí)之間的關(guān)系。
結(jié)果:PLCE1(rs2274223)等位基因 G的發(fā)生頻率在 GCA與正常對(duì)照組分別是29.6%(305/1032)、22.4%(445/1990),差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=18.841, P=0.000, OR=1.457,95%CI=1.229-1.727);在高分化組與低分化組分別為30.3%(120/396)、29.1%(185/636),差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.173, P=0.677,
6、 OR=1.060,95%CI=0.806-1.394)。C20orf54(rs13042395)等位基因 C發(fā)生頻率在GCA及正常對(duì)照組分別為73.1%(754/1032)、69%(1374/1990),差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=5.264, P=0.022, OR=1.216,95%CI=1.029-1.437);在高分化組與低分化組分別為74.2%(294/396)、72.3%(460/636),差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.455
7、, P=0.500, OR=1.103,95%CI=0.830-1.466)。C20orf54mRNA平均表達(dá)量在癌與癌旁組織分別為0.64(±0.11)、0.72(±0.13),差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.091)。C20orf54mRNA高表達(dá)組與低表達(dá)組 C20orf54(rs13042395)等位基因 C的發(fā)生頻率分別為68.3%(41/60)、85%(51/60),差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=4.658,P=0.031, OR=0
8、.381,95%CI=0.156-0.930);低分化發(fā)生率分別為56.7%(17/30)、66.7%(20/30),差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.635, P=0.426, OR=0.654,95%CI=0.229-1.824)。
結(jié)論:PLCE1、C20orf54與 GCA的遺傳易感性相關(guān),有望用于篩查易感人群;兩者與 GCA的分化程度無關(guān),暫不能作為預(yù)測(cè) GCA分化程度的分子指標(biāo);C20orf54mRNA表達(dá)在GCA同一個(gè)
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