TIM-4基因多態(tài)性與中國漢族人群哮喘的相關(guān)性研究.pdf

1、支氣管哮喘是由多種炎癥細(xì)胞（如嗜酸性粒細(xì)胞、肥大細(xì)胞和T淋巴細(xì)胞）及細(xì)胞因子參與的氣道慢性炎癥性疾病，以Th1/Th2平衡失調(diào)為主要特征。一般認(rèn)為哮喘屬于Th2型免疫反應(yīng)，存在向Th2細(xì)胞的免疫偏離。功能上與細(xì)胞的誘導(dǎo)及分化相關(guān)的基因可能通過影響細(xì)胞的誘導(dǎo)與分化進(jìn)而引發(fā)或者促進(jìn)了Th1/Th2平衡失調(diào)節(jié)并在哮喘發(fā)生中發(fā)揮作用，因此這一類基因是很重要的哮喘候選基因。 最近的研究發(fā)現(xiàn)人類TIM（T cell immunoglobul

2、in domain and mucin domain）家族成員可能在CD4+T細(xì)胞的分化與增殖中起作用，是一類可以影響Th1/Th2．平衡的基因。2001年，McIntire在對轉(zhuǎn)基因小鼠哮喘易感基因的研究過程中發(fā)現(xiàn)一個可以調(diào)節(jié)T細(xì)胞與氣道反應(yīng)性的基因座位Tapr（T cell and Airway phenotype Regulator）并在這一基因座位上克隆到了一個新的小鼠基因家族即Tim基因家族，進(jìn)而發(fā)現(xiàn)Tim—1與Tim—3基因

3、多態(tài)位點(diǎn)與小鼠氣道高反應(yīng)性高度相關(guān)。TIM基因家族編碼一類T細(xì)胞表面具有共同基序的Ⅰ型跨膜糖蛋白，基本結(jié)構(gòu)包括信號肽、免疫球蛋翻區(qū)、粘蛋白區(qū)、跨膜區(qū)和帶有磷酸化位點(diǎn)的胞內(nèi)區(qū)。人類的同源基因TIM基因家族位于被多次證明與支氣管哮喘連鎖的5q33．2區(qū)域，包括三個成員TIM—1，TIM—3和TIM—4，功能上均可能與Th1/Th2平衡調(diào)節(jié)有關(guān)。自TIM基因家族發(fā)現(xiàn)以來，對該基因家族成員在不同人群中與哮喘進(jìn)行的相關(guān)性研究成為熱點(diǎn)。我們的前期研

4、究結(jié)果表明位于TIM—1基因上游調(diào)控區(qū)域的一個功能性SNP與漢族人群哮喘具有相關(guān)性，TIM—4作為TIM—1的一個天然醚體，而且TIM—1與TIM—4的相互作用在T細(xì)胞的增殖中具有重要的作用，那么TIM—4是否在哮喘的發(fā)生中也具有作用呢？對此，我們利用病例對照關(guān)聯(lián)分析進(jìn)行了研究。 利用HapMap數(shù)據(jù)庫，我們從TIM—4基因內(nèi)選擇了3個罕見等位基因頻率（Mino allele frequency，MAF）較高的SNP位點(diǎn)，分別是

5、位于啟動子區(qū)域的rs6882076 A/G，位于內(nèi)含子1的rs12658558 G/A，以及位于內(nèi)含子2的rs4704727 G/T，選擇rs6882076的依據(jù)是該位點(diǎn)有可能通過影響轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合而影響基因的表達(dá)水平，從而在疾病的發(fā)生中發(fā)揮作用；選擇后兩個SNP的依據(jù)是因?yàn)楦鶕?jù)HapMap中HCB的數(shù)據(jù)，這兩個SNP均為標(biāo)簽SNP，各自代表著一個不同的連鎖不平衡板塊（Linkage equilibrium block）。利用PCR—R

6、FLP方法在山東收集的年齡與性別匹配的551例哮喘病人和549例正常對照中進(jìn)行了分型。經(jīng)過統(tǒng)計學(xué)分析，三個位點(diǎn)在患者組與對照組均符合Hardy—Weinberg平衡，rs4704727位點(diǎn)和rs6882076位點(diǎn)的基因型、等位基因頻率分布在哮喘組及對照組之間均有統(tǒng)計學(xué)差異，（P=0．005，OR=1．43395% CI1．11—1．84），（P=0．009，OR=1．3595% CI1．07—1．69）。rs12658558位點(diǎn)在患者與

7、對照組的基因型和等位基因頻率分布沒有統(tǒng)計學(xué)差異（P=0．87）。 連鎖不平衡結(jié)果表明，rs4704727位點(diǎn)和rs6882076位點(diǎn)兩者之間的r2為0．12，處于非常弱的連鎖不平衡狀態(tài)，表明這兩個位點(diǎn)很可能在哮喘的發(fā)生中具有獨(dú)立的效應(yīng)。 以上結(jié)果表明，TIM—4基因在漢族人群的哮喘發(fā)生中具有一定的作用，是漢族人群哮喘的一個易感基因，但有待于在其他人群中進(jìn)行進(jìn)一步的驗(yàn)證。此外，還需要對這兩個位點(diǎn)進(jìn)行的功能分析來鑒定它們在哮