

版權說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內容提供方,若內容存在侵權,請進行舉報或認領
文檔簡介
1、目的:造血干細胞(Hematopoietic stem cell,HSC)是一類血液系統(tǒng)成體干細胞,具有長期自我更新的能力和分化成各類成熟血細胞的潛能。造血干細胞命運維持與轉化機制的研究,對血液疾病的預防、診斷和治療具有重要意義,然而這些機制至今仍未被闡明。本研究通過分析基因表達芯片數據尋找造血干細胞與分化、衰老和疾病相關的關鍵基因及其重要功能通路,為進一步探討造血干細胞維持與轉化機制和尋找新的疾病治療靶點奠定基礎。
方法:(
2、1)轉錄組數據選取自GEO數據庫中造血干細胞差異基因表達譜數據。(2)采用編程方法對芯片的原始圖像信號進行預處理,從而得到數據集中有效探針的表達值。(3)選擇基于倍數變化的RankProd算法進行統(tǒng)計分析,獲得顯著差異表達的基因(DEGs)。(4)基于DAVID在線工具進行DEGs的功能注釋與通路富集分析。(5)通過GeneMANIA在線工具構建以功能基因為節(jié)點的差異表達基因的共表達網絡、物理互作網絡;(6)通過StemCellNet在
3、線工具發(fā)現可能與細胞干性相關(linked to stemness)的基因。
結果:(1)分別獲得造血干細胞的分化、衰老和疾病相關數據集5組、4組、3組。(2)成功對芯片的原始圖像信號進行了預處理,并獲得了全部的有效探針表達值。(3)成功獲得大量感興趣的差異表達基因。通過把造血干細胞與前體血細胞、年輕造血干細胞與老化造血干細胞、正常造血干細胞與患有髓系急性白血病的造血干細胞進行基因差異表達分析,分別獲得差異表達基因,并發(fā)現54
4、個在分化、衰老和疾病活動中均有擾動的差異表達基因。(4)成功對差顯基因進行功能注釋,并獲得感興趣的功能通路。(5)獲得差異表達基因共表達網絡、物理互作用網絡;本研究新發(fā)現多個未報到的、可能與細胞干性相關的基因(HERC5、MIR15B、MIR302A等)。
結論:本研究通過差異表達譜研究與功能網絡分析相結合,在確定了大量感興趣的造血干細胞相關基因、通路的同時,發(fā)現了系統(tǒng)基因間的相互作用關系,為揭示造血干細胞及相關疾病的分子機制
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯系上傳者。文件的所有權益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網頁內容里面會有圖紙預覽,若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
- 4. 未經權益所有人同意不得將文件中的內容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內容的表現方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內容負責。
- 6. 下載文件中如有侵權或不適當內容,請與我們聯系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 造血干細胞移植
- 造血干細胞精
- T輔助細胞轉錄因子在異基因造血干細胞移植中的作用.pdf
- 過表達Tcfec對造血干細胞的影響研究.pdf
- 免疫細胞造血干細胞hsc
- 造血干細胞捐獻須知
- 造血干細胞捐獻講座
- 異基因造血干細胞移植早期感染臨床研究.pdf
- 異基因造血干細胞移植術后感染的臨床研究.pdf
- 造血干細胞移植護
- 造血干細胞捐獻者的基因分型
- ABO血型不合對異基因造血干細胞造血重建的影響.pdf
- 異基因造血干細胞移植臨床應用研究.pdf
- 外周血造血干細胞移植的造血重建分析.pdf
- 異基因造血干細胞移植后T細胞免疫重建的研究.pdf
- 造血干細胞血樣采集說明
- 異基因造血干細胞移植預后相關因素分析.pdf
- 造血干細胞捐獻者的hla基因分型
- 造血干細胞移植后的感染
- 再障兒童造血干細胞因子受體mRNA表達和基因結構分析.pdf
評論
0/150
提交評論