11523.癌相關(guān)基因arhgap26和neil1的airna編輯和相關(guān)調(diào)控機(jī)制的研究

1、學(xué)號(hào)：201100370005分類(lèi)號(hào)：碩士學(xué)位論文碩士學(xué)位論文癌相關(guān)基因ARHGAP26和NEIL1的AIRNA編輯和相關(guān)調(diào)控機(jī)制的研究ThestudyonAIRNAeditingregulationmechanismofcancerrelatedgenesARHGAP26NEIL1研究生姓名：馬俊指導(dǎo)教師：鄭秋生教授汪莉副研究員學(xué)科門(mén)類(lèi)：工學(xué)專(zhuān)業(yè)名稱(chēng)：生物化工論文提交日期：2014年6月I摘要RNA編輯是重要的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機(jī)制，其中AI

2、RNA編輯是最重要最普遍的編輯現(xiàn)象，AIRNA編輯反應(yīng)主要由特定的RNA腺苷脫氨酶（ADAR）家族介導(dǎo)催化。它能識(shí)別特定的雙鏈RNA結(jié)構(gòu)和mRNA前體，催化底物上的腺苷酸（A）水解脫氨成為次黃嘌呤（I），在翻譯過(guò)程中I通常會(huì)被核糖體識(shí)別為鳥(niǎo)氨酸G，由此編輯就會(huì)導(dǎo)致核酸序列或者密碼子的改變。RNA編輯可以影響mRNA的穩(wěn)定性和micrNA的加工成熟以及改變micrNA對(duì)其底物分子的識(shí)別等一系列重要的生物過(guò)程。目前已知的ADAR酶家族包括A

3、DAR1、ADAR2、ADAR3和TADAR。在四種編輯酶中，ADAR1是目前研究得最廣泛的編輯酶之一。現(xiàn)代的RNAseq高通量測(cè)序技術(shù)發(fā)現(xiàn)，RNA編輯事件在人類(lèi)基因組中普遍存在，主要發(fā)生于基因組非編碼的重復(fù)序列和CDS區(qū)。AIRNA編輯和人類(lèi)疾病的發(fā)生發(fā)展一直是近年來(lái)該領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。大量的研究表明AIRNA編輯與多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)，例如肝癌，皮膚癌，腦癌等。與相應(yīng)的正常細(xì)胞相比，在癌細(xì)胞中RNA編輯效率明顯改變，相應(yīng)編輯酶的

4、表達(dá)失調(diào)。本課題正是針對(duì)于癌相關(guān)的基因，檢測(cè)其癌與正常的編輯效率差異，初步探討該基因的RNA編輯與癌癥的潛在關(guān)系。本課題對(duì)抑癌基因ARHGAP26的3’UTR，NEIL1的CDS區(qū)的編輯事件進(jìn)行初步研究。分別在腦腫瘤細(xì)胞，白血病患者的白細(xì)胞和乳腺癌細(xì)胞中實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證癌相關(guān)的基因ARHGAP26，NEIL1的潛在編輯位點(diǎn)，通過(guò)實(shí)驗(yàn)確證了ARHGAP26，NEIL1中AIRNA編輯事件的存在，并且編輯效率表現(xiàn)出組織差異性。進(jìn)一步本課題比較了癌和

5、正常組織或細(xì)胞中的RNA編輯效率，實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)相對(duì)于正常的組織或細(xì)胞系，ARHGAP26基因在腦腫瘤細(xì)胞中編輯效率明顯下降，基因NEIL1在白血病患者白細(xì)胞中編輯效率顯著下降，在乳腺癌細(xì)胞系中明顯下降。因此本研究以基因在癌和正常中的編輯差異為線索，來(lái)探究該基因編輯事件的調(diào)控機(jī)制和潛在的功能影響。首先實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證發(fā)現(xiàn)，在腦腫瘤患者的組織細(xì)胞中ARHGAP26基因發(fā)生了AIRNA編輯，主要關(guān)注的12個(gè)編輯位點(diǎn)全部集中在ARHGAP263’UTR區(qū)域