10273.核酸堿基與甘氨酸二肽間氫鍵作用的最佳位點(diǎn)

1、分類(lèi)號(hào)：密級(jí)：學(xué)校代碼：學(xué)號(hào)：10165201311000932逢掌師筢大學(xué)碩士學(xué)位論文核酸堿基與甘氨酸二肽間氫鍵作用的最佳位點(diǎn)作者姓名：刻揚(yáng)學(xué)科、專(zhuān)業(yè)：塹理焦堂研究方向：僉王遮鹽量搓拯導(dǎo)師姓名：董鍪墓三籃生2016年O5月遼寧師范大學(xué)碩士學(xué)位論文摘要研究核酸堿基與蛋白質(zhì)多肽間的氫鍵作用位點(diǎn)對(duì)深入認(rèn)識(shí)核酸與蛋白闖的相互作用機(jī)制，進(jìn)而有效設(shè)計(jì)合成新型生物分子材料有重要指導(dǎo)價(jià)值本文使用B3LYP／6—31G(識(shí)功方法優(yōu)化得到了堿基腺嘌呤、胸

2、腺嘧啶、尿嘧啶、鳥(niǎo)嘌呤及胞嘧啶與甘氨酸二肽分子形成的46個(gè)氫鍵復(fù)合物的穩(wěn)定結(jié)構(gòu)，并使用包含BSSE校正的MP2／augccpVTZ方法計(jì)算了各復(fù)合物的結(jié)合能研究工作主要可歸納為如下幾個(gè)方面：1探討了五種堿基分子與甘氨酸二肽分子之間氫鍵作用的最佳位點(diǎn)研究結(jié)果表明，每種堿基均可通過(guò)多個(gè)位點(diǎn)與甘氨酸二肽分子形成氫鍵復(fù)合物，腺嘌呤、胸腺嘧啶、尿嘧啶、鳥(niǎo)嘌呤及胞嘧啶分別最傾向通過(guò)A3、T1、U1、G3及c1位點(diǎn)與甘氨酸二肽分子形成氫鍵復(fù)合物；甘氨

3、酸二肽可通過(guò)主鏈處的兩種位點(diǎn)(Gly5位點(diǎn)與Gly7位點(diǎn))分別與五種堿基形成氫鍵復(fù)合物，通過(guò)Gty5位點(diǎn)時(shí)與各堿基形成的復(fù)合物更為穩(wěn)定2探究了質(zhì)子化反應(yīng)和去質(zhì)子化反應(yīng)焓變與氫鍵強(qiáng)度的關(guān)聯(lián)研究結(jié)果表明，堿基分子與甘氨酸二肽同一位點(diǎn)相互作用時(shí)，堿基分子某位點(diǎn)處的質(zhì)子化反應(yīng)焓變值越負(fù)所形成的氫鍵復(fù)合物越穩(wěn)定，去質(zhì)子化反應(yīng)焓變值越低所形成的氫鍵復(fù)合物越穩(wěn)定由氫鍵復(fù)合物結(jié)合能計(jì)算所得的穩(wěn)定性次序與由堿基分子質(zhì)子化和去質(zhì)子化反應(yīng)焓變值推測(cè)所得的穩(wěn)定