槲皮素與核酸堿基分子間氫鍵的結合位點.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、深入理解藥物分子和核酸堿基間的相互作用機制對合理設計研發(fā)新型高效藥物有重要意義。
　　本文運用密度泛函理論B3LYP方法對藥物小分子槲皮素與核酸堿基分子A、T、U的氫鍵相互作用位點進行了研究。在B3LYP/6-31G(d)理論水平上優(yōu)化得到了穩(wěn)定的氫鍵復合物，用B3LYP/6-311++G(3df,2p)(BSSE)方法計算了這些復合物的結合能。計算結果表明，槲皮素可以使用4個不同結合位點與尿嘧啶或胸腺嘧啶形成氫鍵復合物，尿嘧啶或

2、胸腺嘧啶可以使用3個不同的結合位點與槲皮素形成氫鍵復合物。當槲皮素的結合位點固定時，槲皮素與尿嘧啶的位點u1或胸腺嘧啶的位點t1形成的氫鍵作用最強，與位點u2或位點t2形成氫鍵強度最弱;當尿嘧啶或胸腺嘧啶的作用位點固定時，二者與槲皮素的位點qu1形成氫鍵作用最強，與位點qu4作用強度次之，與位點qu3的作用強度最弱。槲皮素與腺嘌呤形成15種氫鍵復合物，當槲皮素的結合位點固定時，槲皮素與腺嘌呤五元環(huán)上的N-H比六元環(huán)側鏈上的N-H形成的氫

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