6株豬圓環(huán)病毒流行毒株全基因組的序列測序及分析.pdf

1、Porcine circovirus type2(PCV2)不僅是引起仔豬斷奶多系統(tǒng)衰竭征的主要病原體,而且還與其它病癥相關.PCV2的危害在于能夠使感染豬只的免疫功能受到損害,這種可導致機體免疫抑制的病毒,由于經(jīng)常以亞臨床感染的形式出現(xiàn),常易被忽視.因此應當進一步加強對PCV2感染的流行病學及分子病學研究.該研究采用PCR診斷技術對所收集的73份疑似PCV2病的病料進行檢測,得到18份PCV2陽性病料.采用反向PCR技術對陽性病料中的

2、6株豬圓環(huán)病毒Ⅱ型(PCV2)進行全基因的擴增、克隆和測序,得到長度為1768或1767bp的目的基因片段.應用DNAstar序列分析軟件對所測定的6株PCV2序列進行同源性分析.結(jié)果顯示,六株之間的核苷酸同源性為95.5％~100%.應用計算機分析兩個主要閱讀框ORF1和ORF2并推導其氨基酸序列,分離株ORF1的核苷酸及氨基酸之間的同源性分別為96.9%~100.0%和98.1%~100%,說明ORF1非常保守,這與其編碼蛋白的功能

3、有關.分離株ORF2之間的核苷酸及氨基酸同源性分別為92.9%~100%和92.3%~100%,變異相對于ORF1較大,與國外已發(fā)表毒株的ORF2比較,發(fā)現(xiàn)變異主要發(fā)生在三個區(qū)域,其中兩個與病毒的抗原表位相對應,推測這些變異可能與PCV2抗原性及致病性的改變有關.應用Mega和CLUSTAL分析軟件對分離株和國內(nèi)外已發(fā)表的34株PCV2及2株PCV1序列進行比較,并建立了遺傳進化樹.該進化樹主要分為兩大群,兩個基因型遺傳距離上相對較遠,