水稻組蛋白末端修飾酶OsSRT1和JMJ706的功能研究.pdf

1、組蛋白修飾是表觀調(diào)控的重要分子基礎。其中以組蛋白的甲基化和乙?；顬槌Ｒ姟＝M蛋白去乙?；钢饕蠬D2、Silent information regulation2(SIR2)、ReducePotassium Dependency3(RPD3)三個亞家族。SIR2亞家族的基因可以維持異染色質(zhì)的穩(wěn)定，參與DNA修復，腫瘤形成，抑制脂肪組織的過度累積等生長發(fā)育過程。組蛋白去甲基化酶主要有 Lysine-specific demethylas

2、e(LSD)家族和JmjC-domain-containing histone demethylases(JHDM)家族。植物中的JHDM家族有參與DNA甲基化、影響激素合成、調(diào)節(jié)花期、參與光周期等作用。
　　 水稻中的OsSRT1屬于SIR2亞家族，是一個H3K9去乙酰化酶。它可以提高水稻的抗氧化能力，并維持轉(zhuǎn)座子的沉默。本研究通過3套ChIP-seq的數(shù)據(jù)，分別是MH63材料的OsSRT1抗體和H3K9ac抗體數(shù)據(jù)及OsSR

3、T1-RNAi材料的H3K9ac抗體數(shù)據(jù)。分析了H3K9乙?；揎椇蚈sSRT1在全基因組上的分布以及OsSRT1對H3K9乙酰化分布的影響。得到了3個主要結(jié)論:1，OsSRT1的缺失會影響到很多基因的H3K9乙?；揎棥＿@些基因參與了細胞代謝和植物抗性途徑。2，結(jié)合OsSRT1和H3K9乙?；瘮?shù)據(jù)，找到了157個OsSRT1可能的直接下游基因。3，分析基因組上的轉(zhuǎn)座子，發(fā)現(xiàn)OsSRT1在Gypsy類反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子上有富集。發(fā)掘了OsSR

4、T1可能的結(jié)合motif,該motif也是Gypsy類轉(zhuǎn)座子序列，說明OsSRT1能夠直接結(jié)合在轉(zhuǎn)座子上調(diào)控其活性。
　　 JMJ706屬于JHDM去甲基化酶。它具有去除組蛋白H3K9二甲基化和三甲基化能力并影響花器官的發(fā)育。另外，JMJ706的缺失導致了其胚乳在整個發(fā)育期都變小。對jmj706的胚乳研究表明:1，切片結(jié)果顯示jmj706的胚乳細胞在形態(tài)上沒有明顯差別。2，受精7天的胚乳中儲藏蛋白含量減少，但不是AFL類基因引起