DNA甲基化和組蛋白修飾調節(jié)牛ZAR1基因表達的研究.pdf

1、合子阻滯因子1(ZAR1)是卵母細胞特異的母性效應基，在胚胎早期發(fā)育的母型合子轉變中起重要作用。牛ZAR1是單拷貝基因，位于第六號染色體，基因全長4126 bp，編碼序列為1487bp，具有四個外顯子，3個內含子，包含1155bp的開放閱讀框，編碼387個氨基酸的前體蛋白。該蛋白具有在進化上保守的植物同源結構域PHD，表明ZAR1具有轉錄調節(jié)的作用，DNA甲基轉移酶和組蛋白去乙?；缚赡芡ㄟ^PHD等結構域抑制基因轉錄。ZAR1基因編碼區(qū)

2、有大量的回文序列，能夠形成莖環(huán)結構和十字結構從而改變DNA構象，也可能直接和蛋白質相互作用。短回文序列具有核受體的DNA結合域，調節(jié)核受體的表達。該基因3'非翻譯區(qū)含有UGUA序列和多聚脫腺苷化元件，與ZAR1蛋白的翻譯有關。ZAR1在小鼠卵巢中特異表達，在睪丸中不表達，ZAR1-/-小鼠可以存活，但卻是不育的。ZAR1-/-小鼠在卵巢發(fā)育、卵母細胞發(fā)生和受精后的早期階段雖然正常，但大多數來自ZAR1-/-雌性的胚胎都阻滯于合子期，約有

3、少于20%的胚胎到達2細胞期，但不能發(fā)育到4細胞。牛ZAR1在多種組織中表達，如心臟、睪丸、卵巢、骨骼肌，在胚胎發(fā)育不同階段也有表達，有關該基因表達調控的表觀遺傳學機制還未見報道。本研究利用RT-PCR，亞硫酸鹽測序PCR(PCR，BSP)、染色質免疫共沉淀(ChIP)，等實驗技術對成年牛組織中ZAR1基因表達情況及該基因5'調控區(qū)的DNA甲基化和組蛋白修飾進行了研究，并利用實時定量PCR方法檢測該基因在牛卵母細胞及體外受精胚胎中的mR

4、NA表達的動態(tài)變化。主要研究內容如下：
　　 ⑴利用RT-PCR檢測成年牛心臟、腎臟、肝臟及睪丸中ZAR1基因mRNA的表達。結果顯示ZAR1基因具有組織特異性表達：ZAR1基因在睪丸中表達較高，腎臟和心臟較低，肝臟中未檢測到表達。
　　 ⑵DNA甲基化是調控基因表達的一種方式，主要發(fā)生在CpG位點的胞嘧啶的第5個碳原子上，DNA甲基化并不改變基因的堿基序列，而是通過調節(jié)基因的表達影響其功能。本試驗選定ZAR1基因5'調

5、控區(qū)中的11個CpG位點，以亞硫酸鹽處理的基因組為模板，進行PCR并測序，檢測CpG位點的甲基化狀態(tài)，結果顯示：心臟中的甲基化程度明顯高于其他三種組織，說明該調控區(qū)DNA甲基化與牛ZAR1基因的組織特異性表達相關。
　　 ⑶利用染色質免疫共沉淀方法對成年牛組織中ZAR1基因5'調控區(qū)的H3乙?；3K9甲基化狀況進行了檢測。結果顯示在檢測的組織中心臟組織H3乙酰化程度較高，肝臟中較低。H3乙酰化較高可能與ZAR1在心臟中有表達

6、相關；肝臟中乙?；潭容^低可能與肝臟中未檢測到ZAR1的表達相關。本試驗中沒有在四種組織中檢測到H3K9甲基化，H3K9甲基化與基因沉默相關，這一結果與ZAR1基因在所檢測的牛的幾種組織中的廣泛表達相一致。有研究表明H3K9甲基化最主要作用靶標是衛(wèi)星簇和編碼區(qū)，而不是編碼蛋白基因的啟動子區(qū)，本研究所檢測的調控區(qū)可能不是H3K9甲基化的主要修飾位點。
　　 ⑷研究基因mRNA表達的方法有Northern雜交、實時熒光定量PCR及基

7、因芯片等多種方法，其中實時熒光定量PCR技術不僅能進行初步定量研究，且與常規(guī)PCR相比特異性和靈敏性更強。本試驗采用實時熒光定量PCR方法檢測了ZAR1在牛卵母細胞成熟過程中五個時期(GV、PMI、MI、AI-TI、MII)的mRNA表達狀況。ZAR1在生發(fā)泡和第一次減數分裂前中期表達量較高且有顯著差異，而在第一次減數分裂中期、末期和第二次減數分裂中期表達量較低且沒有顯著差異。
　　 ⑸ZAR1是胚胎發(fā)育的關鍵基因之一，檢測ZA

8、R1的表達狀況為其功能研究提供一些依據。本試驗應用實時熒光定量PCR方法檢測了牛體外受精胚胎中ZAR1基因的表達狀況。研究結果表明ZAR1在2-細胞、4-細胞、8-細胞中表達量較高，且有顯著差異，而在桑椹胚和囊胚中表達量較低，且無顯著差異。
　　 ⑹ZAR1是卵母細胞特異性母性效應基因，在胚胎早期發(fā)育的母型合子轉變中起重要作用。本研究表明牛ZAR1基因的表達具有組織特異性，在心臟、腎臟、睪丸中有表達，肝臟中未檢測到。對ZAR1基