赤鱗魚生長(zhǎng)激素全長(zhǎng)cDNA克隆和結(jié)構(gòu)功能分析.pdf

1、泰山赤鱗魚是一種瀕危珍貴小型魚種，肉質(zhì)分析結(jié)果顯示泰山赤鱗魚具有極高的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值和特殊的藥用價(jià)值，但生長(zhǎng)極其緩慢，對(duì)生存環(huán)境要求苛刻。為了研究赤鱗魚的生長(zhǎng)發(fā)育調(diào)控機(jī)制，進(jìn)一步確定赤鱗魚的種屬分類，我們用SMART RACE技術(shù)克隆了赤磷魚的生長(zhǎng)激素(Growth hormone，GH)的cDNA序列，并用多個(gè)生物信息學(xué)軟件進(jìn)行核酸和氨基酸序列的結(jié)構(gòu)和功能位點(diǎn)分析，為赤磷魚的進(jìn)一步保護(hù)開發(fā)奠定了基礎(chǔ)。所獲成果具體如下：
　　 (1)

2、用SMART RACE技術(shù)克隆了赤磷魚生長(zhǎng)激素基因的cDNA序列。
　　 (2)對(duì)所擴(kuò)赤鱗魚生長(zhǎng)激素cDNA序列進(jìn)行序列分析。結(jié)果顯示所擴(kuò)赤鱗魚生長(zhǎng)激素cDNA序列全長(zhǎng)為1307bp(GenbankID：JN565026)，包括167bp的5’末端和552bp的3’末端及588bp的開放閱讀框。預(yù)測(cè)此開放閱讀框可編碼出一條195個(gè)氨基酸的多肽鏈。通過(guò)基于赤鱗魚生長(zhǎng)激素cDNA和氨基酸序列的進(jìn)化樹分析，我們發(fā)現(xiàn)赤鱗魚和鯉魚、鯽魚的

3、同源率非常高，表明它們有很近的親緣關(guān)系。我們分析了所預(yù)測(cè)的赤鱗魚生長(zhǎng)激素氨基酸序列的功能位點(diǎn)，發(fā)現(xiàn)和鯉科其他魚類相比，赤鱗魚的功能位點(diǎn)的種類，分布和個(gè)數(shù)無(wú)明顯不同。并且通過(guò)赤鱗魚氨基酸序列和其他鯉科魚類進(jìn)行堿基同源比對(duì)，找出赤鱗魚氨基酸序列中與其功能高度相關(guān)的5個(gè)生長(zhǎng)激素中普遍存在的保守結(jié)構(gòu)域。我們預(yù)測(cè)了赤鱗魚生長(zhǎng)激素蛋白的二級(jí)和三級(jí)空間結(jié)構(gòu)，發(fā)現(xiàn)其含有生長(zhǎng)激素特有的四個(gè)反向互補(bǔ)螺旋。
　　 總之，我們首次對(duì)泰山赤鱗魚的生長(zhǎng)激素