甘藍型油菜Cr3529正向消減文庫部分片段的序列分析及反向文庫中一個未知蛋白基因的cDNA克隆.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本文為了從可能的差異表達基因入手研究甘藍型油菜幼葉黃化突變體Cr3529黃化性狀的成因，從本實驗室構建的野生型3529——突變體Cr3529正向抑制性消減雜交(suppressionsubtractivehybridization，SSH)文庫中選取了33個克隆進行序列分析。然后，為了研究反向消減文庫中一個未知基因功能，利用RACE(rapidamplificationofcDNAends)技術，在已知片段的基礎上，對該基因的5’端cD

2、NA進行了擴增，經(jīng)過兩輪PCR得到了該基因5’端約1000bp的序列，將之與原有已知片段拼接得到一個大小為1343bp的片段，序列分析發(fā)現(xiàn)該片段的1～1299位堿基為基因編碼區(qū)；BLAST分析表明，該基因與來自擬南芥的一個編碼未知蛋白質的基因(GenBank登錄號At4g01080)同源性達80.1％，但由于單個堿基的變化，與擬南芥相比，該基因提前終止而在3’端少編碼了9個氨基酸。利用Swiss-model模型對該基因編碼的蛋白進行了結

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