MALDi-TOF-MS分析雞群體遺傳特性及雪山雞肉質(zhì)SNPs位點(diǎn)篩選.pdf

1、基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOF-MS)技術(shù)是目前一種中高通量的SNPs分型平臺(tái)，能夠顯著提高SNP檢測的準(zhǔn)確性。本研究通過MALDI-TOF-MS技術(shù)對13個(gè)群體10個(gè)候選基因的25個(gè)SNPs位點(diǎn)進(jìn)行掃描檢測，對已報(bào)道的SNPs的存在與否進(jìn)行進(jìn)一步驗(yàn)證。同時(shí)以雪山雞為試驗(yàn)材料，對候選SNPs從DNA變異水平進(jìn)行了肉品質(zhì)相關(guān)的遺傳效應(yīng)分析，以期為雪山雞的肉品質(zhì)性狀的分子標(biāo)記輔助選育提供理論基礎(chǔ)。
　　 1、本

2、研究利用飛行質(zhì)譜分析法對肉質(zhì)和抗性相關(guān)的重要的SNPs在13個(gè)群體的504個(gè)個(gè)體中進(jìn)行了檢測，結(jié)果發(fā)現(xiàn)25個(gè)SNPs中的SNP2、SNP6、SNP9、SNP10、SNP19和SNP22不屬于先前報(bào)道的多態(tài)位點(diǎn)，其余的19個(gè)為有效SNPs。
　　 2、雪山雞ADSL基因SNP1、GARS-GART-AIRS基因SNP5、AIRC基因SNP7、PURH基因SNP11、UCP基因SNP12等5個(gè)SNPs同部分常規(guī)肉品質(zhì)指標(biāo)顯著相關(guān)。A

3、DSL基因的SNP1基因型與腿肌剪切力顯著相關(guān)，CT型個(gè)體極顯著高于CC和TT型個(gè)體(P＜0.01);GARS-GART-AIRS基因的SNP5基因型與胸肌系水力顯著相關(guān)，TT型個(gè)體極顯著高于CC和CT型個(gè)體(P＜0.01);AIRC基因的SNP7基因型與胸肌剪切力顯著相關(guān)，TT型個(gè)體顯著高于TC型個(gè)體(P＜0.05);PURH基因的SNP11基因型與腿肌pH值顯著相關(guān)，TT型個(gè)體顯著高于TC型個(gè)體(P＜0.05);UCP基因的SNP1

4、2基因型與腿肌pH值顯著相關(guān)，TC型個(gè)體顯著高于TT和CC型個(gè)體(P＜0.05)，TT和CC型個(gè)體之間差異不顯著(P＞0.05)。
　　 3、AIRC基因SNP7以及GARS-GART-AIRS基因SNP4、SNP5與胸肌肌苷酸含量顯著相關(guān)(P＜0.05)，SNP7中發(fā)現(xiàn)TC雜合型個(gè)體胸肌肌苷酸含量顯著高于TT型個(gè)體(P＜0.05);SNP4中發(fā)現(xiàn)CC型個(gè)體胸肌肌苷酸含量顯著高于AA和AC型個(gè)體(P＜0.05)，AA和AC型個(gè)體

5、之間差異不顯著;SNP5中發(fā)現(xiàn)TT型個(gè)體胸肌肌苷酸含量極顯著高于CC和CT型個(gè)體(P＜0.01)，CC和CT型個(gè)體之間差異不顯著。腿肌肌苷酸含量同胸肌肌苷酸含量的變化趨勢一致，但是差異并不顯著，初步認(rèn)為這些SNPs應(yīng)是肌肉肌苷酸含量的候選標(biāo)記。
　　 4、雪山雞A-FABP基因SNP13與腿肌肌內(nèi)脂肪含量顯著相關(guān)(P＜0.05);THRSP基因SNP14與胸肌肌內(nèi)脂肪含量達(dá)到了顯著關(guān)聯(lián)水平(P＜0.05)。SNP12(UCP基因

6、)、SNP13、SNP14三個(gè)位點(diǎn)與部分胸肌、腿肌脂肪酸含量達(dá)到了關(guān)聯(lián)顯著水平(P＜0.05)。在胸肌中發(fā)現(xiàn)，SNP12的TT型個(gè)體中胸肌C18:1n9c含量、C18∶2n6c含量均顯著高于TC和CC型個(gè)體(P＜0.05);在腿肌中發(fā)現(xiàn)，SNP12的TT型個(gè)體的C16∶0含量顯著高于TC和CC型的個(gè)體(P＜0.05);SNP13中發(fā)現(xiàn)TT型個(gè)體胸肌C16∶0含量顯著高于CT和CC型個(gè)體(P＜0.05);SNP14的GA雜合型個(gè)體中胸肌的

7、C16∶0含量、C18:1n9c含量、C18∶2n6c含量均顯著高于GG和AA型個(gè)體(P＜0.05)。初步認(rèn)為UCP基因、A-FABP基因和THRSP基因是肌肉脂肪性狀的候選標(biāo)記。
　　 5、單倍型分析結(jié)果顯示，雪山雞ADSL和GARS-GART-AIRS基因單倍型H7H8(TTCCCT)個(gè)體的胸肌肌苷酸含量顯著高于其他型個(gè)體(P＜0.05)，表明H7H8型個(gè)體可能是肌苷酸含量的優(yōu)勢個(gè)體;UCP和THRSP基因構(gòu)成的單倍型對肌內(nèi)