中國(guó)漢族人群腦膠質(zhì)瘤遺傳易感性研究——?dú)W洲人群GWAS結(jié)果的驗(yàn)證和精細(xì)定位.pdf

1、復(fù)旦大學(xué)博士學(xué)位論文中國(guó)漢族人群腦膠質(zhì)瘤遺傳易感性研究歐洲人群GWAS結(jié)果的驗(yàn)證和精細(xì)定位姓名：范薇薇申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：博士專(zhuān)業(yè)：遺傳學(xué)指導(dǎo)教師：盧大儒20110415第二部分中國(guó)漢族人群腦膠質(zhì)瘤易感區(qū)域精細(xì)定位研究精細(xì)定位是通過(guò)增加易感區(qū)域內(nèi)遺傳標(biāo)記的檢測(cè)密度，找到與疾病關(guān)聯(lián)程度最強(qiáng)的一組變異，進(jìn)而確定易感基因或者縮小易感區(qū)域和更好地理解疾病通路。國(guó)外已經(jīng)有人應(yīng)用精細(xì)定位在前列腺癌的易感性分析，并獲得了一些新的疾病相關(guān)位點(diǎn)?；谖覀?cè)谥袊?guó)

2、漢族人群中驗(yàn)證14個(gè)與腦膠質(zhì)瘤患病風(fēng)險(xiǎn)強(qiáng)烈相關(guān)的單核苷酸多態(tài)(Singlenucleotidepolymorphism，SNP)位點(diǎn)，發(fā)現(xiàn)分別位于20q1333，1lq233和5p1533這三個(gè)染色體區(qū)域的5個(gè)SNP在中國(guó)漢族人群中與腦膠質(zhì)瘤患病風(fēng)險(xiǎn)強(qiáng)烈相關(guān)，且這三個(gè)染色體區(qū)域可能是中國(guó)人群腦膠質(zhì)瘤患病風(fēng)險(xiǎn)的易感區(qū)域。我們從染色體區(qū)域20q1333，1lq233和5p1533臨近以上三個(gè)風(fēng)險(xiǎn)SNP分別約86kb，96kb矛D15lkb的

3、區(qū)域，基于HAPMAP亞洲人群數(shù)據(jù)利用連鎖不平衡規(guī)律選取了43個(gè)標(biāo)簽SNP位點(diǎn)，在中國(guó)漢族人群983例腦膠質(zhì)瘤病例和1024侈U健康對(duì)照中進(jìn)行精細(xì)定位研究。我們的研究結(jié)果在中國(guó)漢族人群中新發(fā)現(xiàn)了13個(gè)SNP位點(diǎn)的等位基因分布頻率與腦膠質(zhì)瘤患病風(fēng)險(xiǎn)強(qiáng)烈相關(guān)，分別為RTELl區(qū)(20q1333)9個(gè)位點(diǎn)rs6089953，rs6062484，rs3787098，rs2297440，rs2257885，rs3761121，rsl058319，

4、rs5019252，rs6011076，P值為902E05，216E一05，402E04，511E06，140E09，445E07，129E一11，431E08，688E一35；和PHLDBl(1lq2313)4個(gè)位點(diǎn)rs7115634，rs2236661，rs494560，rsl7748，P值為285E04，181E05，432E05，287E05。根據(jù)43個(gè)SNP在983例對(duì)照樣本中的分型數(shù)據(jù)所得到的位點(diǎn)之間連鎖不平衡程度，TERT

5、區(qū)(20q1333)的3個(gè)SNP(rs4635969，rs401681和rs414965)，RTELl區(qū)(20q1333)6個(gè)SNP(rs6089953和rs2738780；rs6062484和rs2297437；rs5019252和rs4809224)及基因PHLDBl區(qū)(1lq233)8個(gè)SNP(rsl2289253和rs3741324；rs494560署Hrsl7748；rsl0892251和rsll216943；rs463996