紅鯽BAC文庫構建及BAC末端測序初步分析.pdf

1、湖南師范大學碩士學位論文紅鯽BAC文庫構建及BAC末端測序初步分析姓名：易新國申請學位級別：碩士專業(yè)：發(fā)育生物學指導教師：劉少軍201206譜的構建以及群體遺傳學的分析奠定基礎。(3)在末端測序的基礎上，我們挑選了3個BAC克隆進行了全長測序，編號為1、2、3，其全長分別為50982bp、15323bp、9663bp。經(jīng)GENESCAN分析，l號BAC中含有7個已注釋基因，基因名為：elementj哆2155kDcIproteintyp

2、el—like、nnnorb、similc伊t0putnt如ereversetrc￡nscr犧tnse、p優(yōu)ntivereverSetranScriptcse、transmembrnnep陽teinl96一li娩、hypotheticc【lp“oteinsTHERM、oRF2一encodedprotetn，基因平均長度為4515bp，其中5個基因預測到具有啟動子，另外，l號中還含有2個未注釋基因；2號BAC克隆含有紅鯽雌二醇受體B的部分

3、核基因組序列，該序列含有5個外顯子序列和5個內含子序列，將獲得的雌二醇受體B的部分編碼區(qū)序列與鯉魚、斑馬魚、青熊、河豚等的相應DNA序列進行了比較并進行了進化樹分析，結果發(fā)現(xiàn)紅鯽與鯉魚的同源性最高；3號BAC經(jīng)測序發(fā)現(xiàn)是由36個長度為263bp的串聯(lián)重復序列組成，該重復序列經(jīng)FISH驗證確認為紅鯽特異性的探針，該重復序列的開發(fā)將能夠十分清晰地闡釋異源四倍體鯽鯉的染色體組成和減數(shù)分裂過程中染色體的交換和重組。關鍵詞：紅鯽；細菌人工染色體文