PPFIA1在慢性粒細胞白血病(CML)的功能及其相關磷酸化信號分子和相互作用蛋白的鑒定研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、研究背景:前期通過基因芯片技術和生物信息學相結合的方法研究發(fā)現(xiàn)miR-181a在慢性粒細胞白血?。–ML)中有多個靶基因,經(jīng)實驗驗證PPFIA1受 miR-181a的直接調控,初步鑒定PPFIA1具有癌基因功能,但PPFIA1在CML中確切的分子作用機制尚不清楚。
  研究目的:本課題致力于探索PPFIA1對CML惡性進展的影響及其下游磷酸化信號分子和相互作用的蛋白鑒定,為白血病分子靶向治療提供新的實驗依據(jù)。
  研究方法:

2、
  1.利用PPFIA1慢病毒顆粒構建穩(wěn)定過表達PPFIA1蛋白的K562細胞;Western Blot驗證K562細胞內PPFIA1表達水平;
  2.脂質體LipofectamineTM3000轉染PPFIA-siRNA到 K562細胞;
  3.Biotool Vita-Blue試劑檢測PPFIA1對K562細胞藥物敏感性的影響;
  4.甲基纖維素集落形成法檢測PPFIA1對K562細胞增殖能力的影響;

3、
  5.Transwell小室法檢測PPFIA1對K562細胞侵襲能力的影響;
  6.磷酸化抗體芯片檢測靶向抑制PPFIA1后K562細胞相應磷酸化蛋白表達水平的改變,并在K562和KCL-22細胞中使用Western Blot驗證相關信號分子的改變;
  7.利用flag-PPFIA1慢病毒顆粒構建穩(wěn)定表達flag-PPFIA1融合蛋白的K562細胞株,flag-BCR/ABL和myc-PARP1質粒構建穩(wěn)定表達

4、flag-BCR/ABL的293T細胞株;
  8.免疫沉淀(IP)flag-PPFIA1和flag-BCR/ABL融合蛋白,利用蛋白質質譜技術鑒定兩組IP產(chǎn)物中的蛋白質組成。
  9.Discovery Studio4.5 Client軟件進行蛋白質結構的空間模擬對接,分別預測與PPFIA1及BCR/ABL蛋白直接作用的特異性蛋白,對免疫沉淀產(chǎn)物中的特異性蛋白質分子進行Western blot實驗驗證。
  10.P

5、ARP1抑制劑Olaparib處理K562-LentiV PPFIA1后CCK8檢測藥物敏感性及細胞克隆形成能力的變化。
  研究結果:
  1.Western Blot檢測病毒感染后K562-PPFIA1 LentiV比K562-empty LentiV細胞內的PPFIA1蛋白表達水平明顯升高;
  2.過表達PPFIA1基因后降低了K562細胞對Imatinib和Dasatinib的藥物敏感性,增強了K562細胞的

6、colony形成和侵襲能力;
  3.靶向抑制PPFIA1增強了K562細胞對Imatinib的藥物敏感性,減弱了K562細胞的colony形成和侵襲能力;
  4.磷酸化芯片顯示,靶向抑制PPFIA1蛋白磷酸化水平下降率高于20%的蛋白有28種。其中C-KIT(Tyr721)磷酸化水平下降最明顯,達76%,Western Blot結果顯示PPFIA1能激活C-KIT、Akt、ERK1/2磷酸化信號通路,靶向抑制PPFIA1

7、可以降低其磷酸化信號水平。
  5.質譜鑒定flag-BCR/ABL免疫沉淀產(chǎn)物有132種特異性蛋白,而flag-PPFIA1免疫沉淀產(chǎn)物有42種,其中PARP1和NCOA5是flag-PPFIA1和flag-BCR/ABL兩個免疫沉淀產(chǎn)物中共同存在的蛋白質分子。
  6.空間模擬對接和免疫共沉淀(Co-IP)結果顯示PPFIA1能和PARP1相互直接結合。
  7.PARP1抑制劑Olaparib能顯著減弱K562-

8、LentiV PPFIA1細胞的活力和colony形成能力。
  8.過表達PPFIA1可以激活PARP1/P65/C-KIT的磷酸化表達水平,靶向抑制PPFIA1和PARP1均可抑制P65和C-kit的磷酸化表達水平。
  研究結論:
  1.PPFIA1在CML中具有癌基因功能,靶向抑制PPFIA1基因的表達可以抑制CML惡性進展。.
  2.PPFIA1下游涉及C-KIT等28個磷酸化信號分子。
  

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