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1、目的:構(gòu)建能同時檢測鳥、海、偶然、堪薩斯及潰瘍分枝桿菌等五種感染手部常見NTM的多重PCR方法,為手部NTM感染的早期診療提供實驗方法。
方法:根據(jù)前期研究成果,1.通過GeneBank數(shù)據(jù)庫和文獻(xiàn)查找鳥、海、偶然、堪薩斯及潰瘍分枝桿菌等五種感染手部常見 NTM的特有基因序列,用MFEprimer-5.0及Olige6.0軟件設(shè)計引物,并用DNAMAN軟件對其進(jìn)行評估,篩選出特異性較高的引物構(gòu)建PCR。2.單一PCR擴增標(biāo)準(zhǔn)菌
2、DNA后進(jìn)行測序,以驗證本研究所用的標(biāo)準(zhǔn)菌是否符合要求。3.利用其引物間無互補或互補性較小的特點,構(gòu)建能同時檢測上述五種NTM的多重PCR,通過優(yōu)化多重PCR的退火溫度,評估其特異性及敏感性。4.用該多重PCR檢測并鑒定12份臨床考慮手部NTM感染的標(biāo)本。
結(jié)果:1.成功為上述五種分枝桿菌設(shè)計了5對特異性引物;2.單一PCR檢測本研究所用的標(biāo)準(zhǔn)菌符合要求;3.成功構(gòu)建了能同步檢測鳥、海、偶然、堪薩斯及潰瘍分枝桿菌五種常見手部N
3、TM感染的五重PCR方法;4.該五重PCR的最佳退火溫度為57.5℃,具有較高的特異性及敏感性;5.該五重PCR檢測12份臨床標(biāo)本,10份標(biāo)本擴增出陽性條帶,檢出率為83%;6、利用該五重PCR檢測NTM可將時間縮短至4小時左右。
結(jié)論:本研究建立的mPCR可同步檢測鳥、海、偶然、堪薩斯及潰瘍分枝桿菌等五種手部常見的NTM感染,具有較高的特異性及敏感性。該方法可迅速將NTM鑒定至種屬及亞種水平,為臨床鑒定NTM感染并制定最佳診
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