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文檔簡介
1、目的:建立穩(wěn)定的重亞硫酸鹽測序(Bisulfite-sequencing PCR,BSP)檢測平臺,檢測人類永生化肝細胞LO2中凝血因子Ⅷ(Coagulation factorⅧ,FⅧ)基因5′端CpG島的甲基化水平,對比檢測正常人新鮮肝組織及L-Arg刺激的LO2細胞FⅧ甲基化CpG島的狀態(tài),探究甲基化的CpG島對FⅧ表達的調控作用。
方法:Methprimer軟件預測FⅧ基因啟動子上游的CpG島,將第一個CpG島劃分為三個
2、獨立片段:CpG is1-1、CpG is1-2及CpG is1-3;第二個CpG島為一個完整片段:CpG is2。并設計BSP引物。運用BSP聯(lián)合TA克隆、藍白斑篩選及質粒PCR,驗證十個陽性單克隆并送測序,BiQ Analyzer軟件對測序結果進行甲基化位點分析,以(甲基化CG位點個數(shù))/(甲基化CG位點個數(shù)+非甲基化位點個數(shù))計算各個CpG位點的甲基化率。RT-PCR檢測LO2細胞、正常人肝組織及L-Arg刺激的LO2細胞FⅧ的轉
3、錄水平,BSP檢測正常人肝細胞及L-Arg刺激的LO2細胞CpG is2的甲基化狀態(tài),SPSS軟件分析三者之間CpG is2的單個CpG位點甲基化率的差異。
結果:人FⅧ基因5′端存在兩個CpG島:CpG island1位于-4879─-4071,全長809bp;CpG island2位于-3600─-3323,全長278bp。LO2細胞中,CpG is1-1共12個CpG位點,整體甲基化率為0%;CpG is1-2共40個C
4、pG位點,整體甲基化率為0-20%;CpG is1-3共27個CpG位點,整體甲基化率為0-20%;CpG is2共23個CpG位點,整體甲基化率為80-100%。RT-PCR結果顯示:LO2細胞不轉錄FⅧ;正常人肝細胞及L-Arg刺激LO2細胞36小時后能檢測到FⅧ的轉錄。對比檢測CpG is2甲基化水平,正常人肝組織為70%-100%,L-Arg刺激LO2細胞為60%-100%。LO2細胞、正常人肝組織及L-Arg刺激的LO2細胞C
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