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1、南昌大學(xué)碩士學(xué)位論文草魚CNBP、eIF5A的克隆、組織表達及進化分析姓名:陳瓊申請學(xué)位級別:碩士專業(yè):動物學(xué)指導(dǎo)教師:林剛20081212AbstractAbstractCtenopharyngodonidellacellularnucleicacidbindingprotein(CNBP)andeukaryotictranslationinitiationfactor5A(elF5A)hadbeenclonedfromthelive
2、randkidneygrasscarpeDNAlibrary111efulllenghthgrasscarpCNBPWaS1948bp,whichcontaineda5’untranslatedregionof33bpanda3’untranslatedregionof1423bp111eopenreadingframewas492bp,whichcouldcodea163aminoacidpolypeptideGrasscarpCNB
3、PcontainedsevenCCHCzincfingerdomainsnuclear10catedsignalandallRGGbox,whichwashiglllyconservedinfishComparedwithhumanandothervertebrates,25aminoacidresiduesWassubsitutedingrasscarpCNBPthefifthglycineresidueatthethirdzincf
4、ingerdomainWaSsubstitutedwithhistidineand614aminoacidresidueswereabsentbetweenthefirstandthesecondzincfingerinthegraSscarpCNBPNevertheless,thegraSscarpCNBPWaSnotinthepositiveDarwinselection((I)≤1)byadaptiveevolutionanaly
5、sisTherefore,newfunctionWaSnotgeneratedbystructuraldifferenceofCNBETheseindicatedthatCNBPWaSintheneutralselectionRTPCRexperimentindictedthatinthenormalliverintestine,kidneyspleen,heart,muscle,gillandbrainofgraSscarp,theC
6、NBPhadthehi曲estexpressionallevelinheart,thebrainandgillrankedsecondlyandweaklyinkidneyThefblllengtheDNAsequenceofgraSscarp棚1朝WaS2249bp,whichcontaineda5’untranslatedregionof41bpanda3’untranslatedregionof1743bpTheopenreadi
7、ngframeWaS465bpwhichcouldcodea155aminoacidpolypeptidewithamolecularmaSsof16856kuandpI518GraSscarpelF5AcontainstheunusualbaSicaminoacidhypusinethatconservedineIF5AfamilyattheNterminalregionanda1eucinefichstretchattheC—ter
8、minalregionAnditscompleteaminoacidsequencesharedhighlyidentitywithelF5Afromhumanandotherspecies,onlyseveralaminoacidresiduesweresubstitutedAdaptiveevolutionanalysisalsoindicatedthatelf一5AWaSnotonlyconservedinstructurebut
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