非鍵作用和庫(kù)侖模型預(yù)測(cè)甘氨酸-α-多肽構(gòu)象穩(wěn)定性.pdf

1、本文采用密度泛函理論B3LYP/6-31G*方法，對(duì)甘氨酸-α-二肽、三肽、四肽、五肽和六肽分子進(jìn)行了計(jì)算。對(duì)構(gòu)象中的主要非鍵相互作用進(jìn)行分析，確定了影響構(gòu)象穩(wěn)定性的主要非鍵作用，并估算了相關(guān)非鍵作用的能量。將之應(yīng)用于判斷二肽、三肽、四肽、五肽和六肽分子構(gòu)象的相對(duì)穩(wěn)定性，得到了滿意的結(jié)果。進(jìn)而建立甘氨酸-α-多肽的庫(kù)侖模型，探討了電荷在庫(kù)侖模型中的作用，確立了各種非鍵作用的能量參數(shù)。用本文方法及庫(kù)侖模型方法預(yù)測(cè)多肽構(gòu)象的相對(duì)穩(wěn)定性，得到

2、了滿意的結(jié)果。具體包括： 1)以甘氨酸-α-二肽、三肽、四肽、五肽和六肽分子的52個(gè)穩(wěn)定構(gòu)象為研究對(duì)象，對(duì)構(gòu)象中的主要非鍵相互作用進(jìn)行分析，確定了其相應(yīng)參數(shù)值，使用此參數(shù)值和多肽分子構(gòu)象的分子結(jié)構(gòu)圖，確定構(gòu)象的相對(duì)能量，與密度泛函理論B3LYP方法得到的相對(duì)能量比較，得到了滿意的結(jié)果。 2)選擇甘氨酸-α-多肽的庫(kù)侖模型，確定相關(guān)非鍵作用能量的相應(yīng)參數(shù)K。利用庫(kù)侖模型、參數(shù)K和密度泛函理論B3LYP/6-31G*方法優(yōu)化