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1、SLC4家族蛋白是一類(lèi)重要的酸堿調(diào)控蛋白,對(duì)維持機(jī)體酸堿平衡、調(diào)控細(xì)胞內(nèi)外pH和促進(jìn)HCO3-的重吸收或者分泌具有重要的作用。SLC4家族共含有十個(gè)成員。其中NBCn1和NBCn2分別由Slc4a7和Slc4a10編碼,都是電中性的Na+/HCO3-共轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白。NBCn1和NBCn2在基因結(jié)構(gòu)及蛋白一級(jí)序列上有著很高的同源性。
每個(gè) SLC4家族基因都能夠通過(guò)選擇性轉(zhuǎn)錄或者選擇性剪接產(chǎn)生多種剪接異構(gòu)體。選擇性轉(zhuǎn)錄和選擇性剪接對(duì)
2、SLC4家族蛋白的表達(dá)和轉(zhuǎn)運(yùn)功能具有重要的調(diào)控作用。在此前的研究中,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)Slc4a7含有3個(gè)可選擇性剪接外顯子cassette I、cassette II和cassette III,并且在人類(lèi)組織中發(fā)現(xiàn)了NBCn1-A和NBCn1-F,在小鼠和大鼠組織中發(fā)現(xiàn)了NBCn1-B/C/D/E。人類(lèi)NBCn1的Nt(N terminus,Nt)以11個(gè)特異性氨基酸殘基為起始,稱(chēng)為MERF-NBCn1,而嚙齒類(lèi)NBCn1的N端以16個(gè)特異性氨
3、基酸殘基為起始,稱(chēng)為MEAD-NBCn1。在本研究開(kāi)展之前并不知道人類(lèi)基因組能否產(chǎn)生MEAD-NBCn1,小鼠組織能否產(chǎn)生MERF-NBCn1,也不清楚NBCn1的選擇性剪接元件對(duì)各個(gè)NBCn1剪接異構(gòu)體表達(dá)和轉(zhuǎn)運(yùn)功能的影響。
在本研究中,我們首次發(fā)現(xiàn)小鼠基因組既能夠產(chǎn)生MEAD-NBCn1,又能夠產(chǎn)生MERF-NBCn1。此外,我們發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)新的可選擇性剪接外顯子exon3和exon11(又稱(chēng)cassette IV)。根據(jù)小
4、鼠Slc4a7基因含有的2個(gè)5,UTR和5個(gè)可選擇性剪接外顯子,我們共鑒定了12個(gè)新的NBCn1剪接異構(gòu)體。在這12個(gè)NBCn1剪接異構(gòu)體中,有10個(gè)是全長(zhǎng)型MEAD-NBCn1和MERF-NBCn1;1個(gè)是全長(zhǎng)型NBCn1-R,NBCn1-R的Nt以21個(gè)特異性氨基酸起始,稱(chēng)為MIPL-NBCn1;1個(gè)是NBCn1-Q,相比全長(zhǎng)型MERF-NBCn1而言,NBCn1-Q缺失了Nt115個(gè)氨基酸殘基,稱(chēng)為MDEL-NBCn1。通過(guò)電生理
5、學(xué)手段和生物素酰化方法分析NBCn1剪接異構(gòu)體在爪蟾卵母細(xì)胞中的轉(zhuǎn)運(yùn)活性和膜蛋白表達(dá),我們發(fā)現(xiàn)NBCn1的特異性Nt和可選擇性剪接元件能夠影響NBCn1的轉(zhuǎn)運(yùn)功能和上膜能力。MEAD型Nt傾向于提高而cassette IV傾向于減少NBCn1的上膜表達(dá),cassette II、cassette III和cassette IV都傾向于增強(qiáng)NBCn1的單分子轉(zhuǎn)運(yùn)活性。當(dāng)在爪蟾卵母細(xì)胞中表達(dá)時(shí),MIPL-NBCn1即NBCn1-R能夠表現(xiàn)出正
6、常的Na+/HCO3-轉(zhuǎn)運(yùn)活性,而MDEL-NBCn1即NBCn1-Q的Na+/HCO3-轉(zhuǎn)運(yùn)活性較為微弱,但是NBCn1-Q仍能表現(xiàn)出明顯的Na+電導(dǎo)活性。
與Slc4a7基因類(lèi)似,Slc4a10也能夠通過(guò)選擇性轉(zhuǎn)錄和選擇性剪接產(chǎn)生多種轉(zhuǎn)錄本。我們課題組的前期western blot結(jié)果表明,MCDL-NBCn2在大鼠腎臟中的蛋白表達(dá)非常豐富,但是根據(jù)已有的cDNA序列設(shè)計(jì)引物,無(wú)法擴(kuò)增得到MCDL-NBCn2 cDNA全長(zhǎng)
7、,只能夠得到起始密碼子“ATG”下游片段。因此我們猜測(cè),在大鼠腎臟中,Slc4a10的MCDL-NBCn2轉(zhuǎn)錄本很有可能含有一個(gè)新的5,UTR,并且MCDL-NBCn2的轉(zhuǎn)錄受到一個(gè)新的啟動(dòng)子調(diào)控。
通過(guò)5,RACE和熒光素酶活性分析,我們發(fā)現(xiàn)大鼠 Slc4a10基因含有一個(gè)新的啟動(dòng)子(P2),從此啟動(dòng)子進(jìn)行轉(zhuǎn)錄,大鼠Slc4a10既能夠產(chǎn)生MCDL-NBCn2,又能夠產(chǎn)生Nt截短的NBCn2剪接異構(gòu)體。Nt截短的NBCn2異
8、構(gòu)體以“MHAN”為起始,稱(chēng)為MHAN-NBCn2。當(dāng)在neuro-2a細(xì)胞中外源表達(dá)時(shí),MHAN-NBCn2幾乎全部滯留在細(xì)胞質(zhì)中。通過(guò)一系列的Nt截短,我們發(fā)現(xiàn)NBCn2的Nt氨基酸序列“HDLFTEL”對(duì) NBCn2的正常上膜具有重要的作用。當(dāng)全長(zhǎng)型 NBCn2與 Nt截短型 NBCn2在neuro-2a細(xì)胞中共表達(dá)時(shí),全長(zhǎng)型NBCn2能夠顯著增強(qiáng)Nt截短型NBCn2的上膜表達(dá)。免疫共沉淀和雙分子熒光互補(bǔ)實(shí)驗(yàn)表明在 neuro-2
9、a細(xì)胞中,全長(zhǎng)型 NBCn2與Nt截短型NBCn2能夠形成異源二聚體。最后,我們的實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示獨(dú)立的Nt結(jié)構(gòu)域仍然能夠與Nt截短型NBCn2相互作用并增強(qiáng)Nt截短型NBCn2在neuro-2a細(xì)胞中的上膜表達(dá)。
通過(guò)比較分析SLC4家族的NBCn1、NBCn2和NBCe2的Nt截短蛋白在neuro-2a細(xì)胞中的定位,結(jié)合我們?cè)诒狙芯恐泻蛣e的課題組的電生理研究成果,我們發(fā)現(xiàn)NBCn1、NBCn2和NBCe2的Nt可變區(qū)1(var
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