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文檔簡介
1、蛋白質精氨酸甲基化是生物體中普遍的翻譯后修飾之一,它由蛋白質精氨酸甲基化酶家族(PRMTs)催化,對多種細胞生理過程具有重要調節(jié)作用。哺乳動物中存在3種類型的PRMTs蛋白,研究表明其活性異常與許多疾病的發(fā)生發(fā)展有關,是心血管疾病、乳腺癌、白血病等疾病的潛在藥物靶點。
PRMT1是最重要的Ⅰ型PRMT蛋白,它的催化活性占哺乳動物PRMTs總活性的85%以上,研究其特異性的小分子抑制劑顯得尤為重要。本論文借助基于配體的計算機輔助
2、藥物設計,采用SHAFT(SHApe-FeaTure Similarity)的方法,以已報道的PRMT1小分子抑制劑MS023和DB75為模板,對臨床藥物數(shù)據(jù)庫進行搜索,得到一系列候選化合物;通過構建TR-FRET酶活測試體系進行初篩,發(fā)現(xiàn)化合物Pentamedine具有一定的活性;接下來,采用放射性同位素方法進一步確證該化合物能夠抑制PRMT1酶活,并測定半數(shù)抑制濃度IC50=13.2±0.3μM;緊接著,我們通過化學合成得到一系列P
3、entamedine的衍生物,并研究其構效關系,最終得到了另一個PRMT1抑制劑Hexamideine,其分子水平IC50=5.9±1.7μM;之后,我們采用分子對接結合Thermal shift、NMR等生物物理實驗進一步探究Hexamidine與蛋白的結合模式,發(fā)現(xiàn)其是PRMT1的雙底物競爭性抑制劑;最后細胞水平增殖實驗表明,該化合物能夠時間和濃度依賴性地抑制A549等細胞系的增殖,Western Blot實驗確證該化合物能夠在細胞
4、內抑制PRMT1酶活。
PRMT5是最重要的Ⅱ型PRMT蛋白,與白血病、淋巴瘤、乳腺癌等有關,是潛在的藥物靶點。本論文借助基于受體的計算機輔助藥物設計,對PRMT5晶體結構進行分子對接,經(jīng)聚類分析以及手動篩選得到120個化合物;通過放射性同位素初篩得到DC_Y53,其分子水平IC50=5.7μM;緊接著,我們通過相似性搜索進行結構優(yōu)化,得到DC_Y134其體外IC50=1.7μM,且具有較好的選擇性。最后細胞實驗表明,DC_Y
5、134能夠時間和濃度依賴性地抑制多種白血病和淋巴瘤細胞的增殖,且對MV4-11細胞的抑制作用最為明顯。Western Blot實驗表明該化合物可以抑制胞內PRMT5酶活,流式細胞術實驗表明DC_Y134能夠將細胞周期阻滯在G0/G1期,并且促進腫瘤細胞凋亡。
綜上所述,我們以計算機輔助藥物設計為出發(fā),結合生物實驗確證,得到了具有選擇性的靶向PRMT1的小分子抑制劑Hexamideine(IC50=5.9±1.7μM)以及PRM
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