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文檔簡介
1、目的:組蛋白的翻譯后修飾是表觀遺傳調控的重要內容,已被證實在腫瘤的發(fā)生和發(fā)展過程中扮演了重要的角色。環(huán)指蛋白2(ring finger protein2,RNF2)是多梳蛋白抑制性復合物1(polycomb repressive complex1,PRC1)的催化亞單位,可介導組蛋白H2A(histone2A,H2A)的單泛素化修飾。研究表明,RNF2在多種腫瘤中呈特異性高表達,且具有促腫瘤效應。但是RNF2在前列腺癌(prostate
2、 cancer,PCa)中的研究還鮮有報導。在本研究中,我們首先通過對PCa組織和良性前列腺增生組織(benign prostatic hyperplasia,BPH)中RNF2的表達進行檢測,以明確RNF2在PCa中的表達水平。隨后,通過在PCa細胞系中特異性下調RNF2的表達,檢測細胞周期、凋亡和細胞活力的變化,以明確RNF2在PCa中的生物學功能。進一步,我們通過尋找差異性表達基因,篩選、驗證受RNF2調控的下游靶基因并探索其相關
3、的分子機制。
方法:
1.利用免疫組織化學染色(immunohistochemistry,IHC)對含有PCa(n=81)和BPH(n=71)的組織芯片(tissue microarray,TMA)進行RNF2的染色并利用H-Score評分系統對RNF2的表達水平進行評分,對PCa組織和BPH組織中RNF2的表達進行差異性分析,并對PCa組織中RNF2的表達水平與腫瘤的Gleason評分進行相關性分析。
2
4、.設計并合成靶向RNF2的特異性小干擾RNA(small interfering RNA,siRNA)(siRNF2#1和siRNF2#2)以及陰性對照siRNA(siNC)。將它們轉染DU145和LNCaP細胞并利用實時定量PCR(quantitative real-time PCR,RT-qPCR)和蛋白電泳(western blot,WB)對下調效果分別在mRNA水平和蛋白水平進行驗證。利用流式細胞術(flow cytometry
5、,FCM)對各處理組細胞的凋亡和細胞周期進行檢測。利用噻唑藍比色法(3-(4,5-dimethyl-2-thiazolyl)-2,5-diphenyl-2-H-tetrazolium bromide assay,MTT assay)檢測各處理組細胞的活力。
3.設計并合成靶向 RNF2的特異性短發(fā)卡RNA(short hairpin RNA,shRNA)(shRNF2#1和shRNF2#2)及對照shRNA(shScr),構建
6、帶綠色熒光蛋白(green fluorescence protein,GFP)的shRNA慢病毒表達載體。將慢病毒包裝載體及shRNA表達載體共同轉染293T細胞進行慢病毒的包裝,所得慢病毒分別命名為shRNF2#1、shRNF2#2和shScr。所得慢病毒分別感染DU145和LNCaP細胞,熒光顯微鏡下觀察感染效率。利用RT-qPCR和WB檢測RNF2的下調效果,利用FCM和MTT檢測各處理組細胞的周期、凋亡和細胞活力變化。
7、 4.將shRNF2#1、shRNF2#2和shScr感染后的DU145細胞進行擴大培養(yǎng),以5×106個細胞分別接種于裸鼠背外側近右側大腿處,觀察各處理組移植瘤的生長情況,繪制生長曲線。觀察結束后對所有實驗小鼠實施安樂死,對腫瘤組織進行固定、包埋和切片。利用IHC對各處理組腫瘤組織中增殖細胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)和活化型半胱天冬酶-3(cleaved caspase-3,
8、cleaved-casp3)進行染色,以評價細胞的增殖和凋亡情況。
5. siRNF2#1、siRNF2#2和siNC分別轉染DU145細胞,72小時后提取各處理組細胞總RNA并送上海伯豪生物技術公司進行數字基因表達譜檢測,尋找RNF2下調組細胞與正常對照組細胞的差異性表達基因,并利用GeneOntology、BioCarta-ATCG等在線數據庫對差異性表達基因進行基因本體(Gene Ontology,GO)分析。利用RT-
9、qPCR和WB進行驗證,尋找RNF2的潛在功能性下游靶基因。對方法4中所得各處理組移植瘤組織進行RNF2和相應靶基因的IHC染色,驗證二者的相關性。
6.針對前期實驗篩選出的RNF2潛在下游靶基因硫氧還蛋白結合蛋白基因(thioredoxin interacting protein,TXNIP)設計合成特異性siRNA和shRNA,構建shRNA的慢病毒表達載體并進行慢病毒包裝,分別命名為siTXNIP和shTXNIP。利用s
10、iTXNIP和shTXNIP對RNF2下調細胞進行功能學挽救實驗。siRNA實驗分組為:siRNF2#1、siTXNIP、siRNF2#1+siTXNIP和siNC;shRNA實驗分組為:shRNF2#1、shTXNIP、shRNF2#1+shTXNIP和shScr。利用RT-qPCR和WB檢測各處理組細胞RNF2和TXNIP的表達水平,利用FCM和MTT檢測細胞的周期、凋亡和細胞活力的變化。
7.針對TXINP基因啟動子區(qū)設
11、計特異性PCR引物,利用染色質免疫共沉淀技術(chromatin immunoprecipitation,ChIP)檢測TXNIP啟動子區(qū)RNF2的富集和組蛋白H2AK119Ub的水平。利用siRNA特異性下調RNF2的表達后,檢測RNF2和H2AK119Ub在TXNIP啟動子區(qū)的富集和水平變化。
結果:
1.對TMA的IHC染色和H-Score評分結果顯示,PCa組織中RNF2的表達水平(H-Score:117.5
12、3±62.34)明顯高于BPH組織(H-Score:90.14±63.66)。PCa組織中,RNF2的表達水平與Gleason評分的相關性分析結果顯示,Gleason評分高(Gleason評分>7)的PCa組織中RNF2的表達水平(H-Score:150.50±62.03)明顯高于Gleason評分低(Gleason評分≤6)的PCa組織(H-Score:97.10±53.63)。
2.RT-qPCR和WB結果顯示,siRNF
13、2#1和siRNF2#2均能在mRNA水平和蛋白水平有效下調RNF2的表達。FCM檢測結果顯示,與對照組細胞相對,RNF2下調組DU145和LNCaP的G1期細胞和凋亡細胞顯著增加。MTT結果提示,RNF2下調組細胞的活力較正常對照組顯著降低。
3.成功包裝能特異性下調RNF2的慢病毒顆粒并能有效感染目的細胞。RT-qPCR和WB結果顯示,shRNF2#1和shRNF2#2均能在mRNA水平和蛋白水平有效下調RNF2的表達。細
14、胞功能學實驗結果顯示,shRNF2#1和shRNF2#2可誘導DU145和LNCaP細胞的G1期阻滯、凋亡增加和細胞活力下降。
4.成功建立了shScr、shRNF2#1和shRNF2#2慢病毒感染后的DU145細胞裸鼠移植瘤模型。結果顯示,shScr、shRNF2#1和shRNF2#2處理組移植瘤在觀察終點的體積分別為846.80±55.29mm3、304.33±63.72mm3和331.93±84.42mm3。腫瘤生長曲線
15、結果顯示,實驗組移植瘤的生長速度顯著低于對照組。IHC染色結果顯示,與shScr處理組相比,shRNF2#1和shRNF2#2處理組腫瘤組織中PCNA的表達水平明顯降低,而cleaved-casp3的水平顯著增加。
5.對數字基因表達譜結果的分析顯示,特異性下調RNF2所導致的≥1.5倍的差異化表達基因達632個,其中144個基因表達上調。利用Gene Ontlogy和BioCarta-TCGA等數據庫的GO分析結果顯示,大量
16、差異性表達基因參與細胞周期、有絲分裂、增殖和凋亡等生物學行為的調控?;赑cGs的轉錄抑制功能考慮,我們重點對表達顯著上調的基因進行了分析、篩選并利用RT-qPCR和WB進行驗證。結果顯示,與細胞增殖、凋亡和周期調控密切相關的TXNIP是RNF2潛在的重要功能性下游靶基因。對DU145細胞裸鼠移植瘤組織的IHC染色結果顯示,RNF2下調組的腫瘤組織中TXNIP的表達水平顯著高于對照組腫瘤組織。
6.RT-qPCR和WB結果顯示
17、,siTXNIP和shTXNIP均能有效下調TXNIP的mRNA水平和蛋白水平。FCM結果顯示,通過siRNA或shRNA同時下調RNF2和TXNIP可有效挽救單獨下調RNF2所導致的DU145和LNCaP細胞凋亡增加和G1期阻滯。MTT實驗結果顯示,同時下調RNF2和TXNIP可有效挽救單獨下調RNF2所導致的DU145和LNCaP細胞活力降低。
7.ChIP實驗結果顯示,RNF2可直接結合于TXNIP的啟動子區(qū)并促進組蛋白
18、H2AK119的單泛素化。利用siRNA特異性下調RNF2的表達后,RNF2的富集和H2AK119Ub的水平均顯著降低。
結論:
1.RNF2在PCa中的表達水平顯著高于BPH,且其表達水平與腫瘤的Gleason評分呈正相關,RNF2在PCa的發(fā)生發(fā)展過程中具有促腫瘤效應。
2.RNF2對PCa細胞的周期、凋亡和細胞活力有重要的調控作用,下調RNF2可誘導PCa細胞發(fā)生周期阻滯,凋亡增加和細胞活力下降,并可
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