雞leT-7a的組織表達(dá)、功能預(yù)測(cè)及其靶基因ADIPOR2遺傳效應(yīng)分析.pdf

1、let-7家族是最早被發(fā)現(xiàn)的在物種間高度保守的廣泛性表達(dá)miRNA，在腫瘤細(xì)胞的增殖、分化、脂肪生成及藥物敏感性等方面發(fā)揮重要調(diào)控作用。前期我們采用Solexa高通量測(cè)序技術(shù)構(gòu)建了固始雞1日齡和36周齡兩個(gè)發(fā)育階段下丘腦的miRNA表達(dá)譜，分析發(fā)現(xiàn)let-7家族的8個(gè)成員在雞下丘腦發(fā)育過(guò)程均呈高豐度差異性表達(dá)，尤其是let-7a，這表明let-7家族的miRNA在雞下丘腦發(fā)育過(guò)程可能發(fā)揮重要調(diào)節(jié)作用。但目前有關(guān)雞let-7a功能的研究尚

2、未見(jiàn)報(bào)道。
　　本研究采用實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè)了let-7a在固始雞14日齡胚胎、17日齡胚胎、1日齡雛雞和36周齡成年雞的13種不同組織中的表達(dá)情況;利用兩種算法預(yù)測(cè)了let-7a的靶基因，并對(duì)共有靶基因進(jìn)行了GO富集分析和KEGG通路分析;根據(jù)生物信息學(xué)分析結(jié)果，利用實(shí)驗(yàn)室固始雞-安卡雞資源群體素材，探討了let-7a靶基因脂聯(lián)素受體2 Adiponectin receptor2(ADIPOR2)的遺傳效應(yīng)，分析了該基因的時(shí)序表

3、達(dá)特征及其SNP與雞生產(chǎn)性狀間的關(guān)聯(lián)性，主要結(jié)果如下:
　　1.let-7a在所檢測(cè)的組織中呈廣泛性表達(dá)，其在下丘腦中的表達(dá)趨勢(shì)與高通量測(cè)序結(jié)果一致;但組織間的表達(dá)量卻存在較大的差異。14日胚齡和17日胚齡時(shí)，在腦組織和內(nèi)臟組織中表達(dá)量均較高;1日齡時(shí)，let-7a在下丘腦、小腦、胸肌、肌胃和腎臟等組織中高豐度表達(dá)，在肺中低豐度表達(dá)，其它組織中適度表達(dá);36周齡時(shí)，let-7a在各組織中的表達(dá)量均相對(duì)較低。
　　2.對(duì)let

4、-7a的107個(gè)預(yù)測(cè)的靶基因進(jìn)行了GO富集分析和KEGG通路分析，結(jié)果顯示靶基因主要在生物學(xué)過(guò)程調(diào)節(jié)相關(guān)的生物學(xué)過(guò)程中富集，尤其是與礦物質(zhì)和磷代謝相關(guān)的調(diào)節(jié)過(guò)程;且在粘著斑、細(xì)胞外基質(zhì)受體互作、MAPK信號(hào)通路等3個(gè)通路中顯著富集(P＜0.01)。
　　3.let-7a預(yù)測(cè)的靶基因ADIPOR2在雞不同生長(zhǎng)階段不同組織中廣泛性表達(dá)。隨著生長(zhǎng)發(fā)育，ADIPOR2在大腦和肌胃兩種組織中的表達(dá)水平與let-7a的表達(dá)水平變化趨勢(shì)是相反的

5、;在肺中，兩者表達(dá)水平變化趨勢(shì)一致;但在腎臟和小腦等其它10種被檢測(cè)的組織中，兩者表達(dá)水平的變化趨勢(shì)沒(méi)有呈現(xiàn)明顯的對(duì)應(yīng)關(guān)系。這些結(jié)果表明，let-7a和ADIPOR2基因在大腦和肌胃發(fā)育過(guò)程存在潛在的互作關(guān)系。
　　4.對(duì)let-7a潛在靶基因ADIPOR2的SNP關(guān)聯(lián)分析結(jié)果表明，g.34490C＞T突變與肝臟重和血液球蛋白顯著相關(guān)（P＜0.05），g.35363T＞C與6、10和12周齡體重顯著相關(guān)(P＜0.05)，這兩個(gè)多態(tài)