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文檔簡介
1、本實驗室利用兩種預測模型在全基因組范圍內進行候選印記基因篩選,得到若干候選基因,本課題所研究的基因 Arfip2就是其中之一。該基因的以往研究多集中于其蛋白的功能,對該基因表達模式的研究還未見報道。本課題對Arfip2蛋白進行了生物信息學分析后,重點分析了該基因在小鼠胚胎發(fā)育中后期的表達模式,并對該基因的印記狀態(tài)和調控機制進行了初步研究,為進一步研究該基因的表達模式奠定了基礎。
生物信息學分析表明,該基因位于小鼠7號染色體上,
2、基因全長6.2kb,其編碼蛋白為 ADP核糖基化因子結合蛋白2,屬于Arfaptin家族。該基因是一個進化保守的基因,其蛋白功能域結構和BAR結構域十分類似。本課題利用基于 SNP的直接測序法分析了Arfip2基因的印記狀態(tài),結果顯示在小鼠E15.5天胚胎的主要組織(腦、舌、心臟、肺臟、肝臟、腎臟、胎盤)中,該基因呈現出雙等位表達的模式。之后,我們利用原位雜交和實時定量 PCR技術詳細研究了在小鼠胚胎發(fā)育中后期Arfip2基因的表達模式
3、。結果顯示,該基因在 E9.5~E11.5天的胚胎中特異地只在腦中表達,其表達主要分布在端腦、中腦、菱腦。在 E12.5天的胚胎中,Arfip2基因表現出廣泛表達的模式。在E12.5天的腦、舌、肝臟中檢測到該基因強烈的表達信號,在心臟、肺臟、腎臟中的信號則相對較弱。在 E15.5天的胚胎中,Arfip2的表達廣泛分布在腦、舌、肺臟、肝臟、腎臟和胸腺等組織中,而在心臟中的表達依然很低。定量PCR結果顯示,在小鼠胚胎發(fā)育后期 Arfip2基
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