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文檔簡介
1、本文主要從以下幾部分展開論述:
第一部分 一組α螺旋抗菌肽的預測與活性測定
實驗目的:α-螺旋抗菌肽是一類具有廣譜抗菌作用的多肽,本文選取抗菌肽CP26的N端1-11個氨基酸和P18 C端的10-18個氨基酸雜合,組成新的雜合多肽CP-P(KWKSFIKKLTSKFLHLAKKF)。然后通過氨基酸置換修飾共獲21種抗菌肽,分別檢測它們的體外抗菌活性和溶血毒性,并通過家兔燒傷模型對其中活性較好的抗菌肽進行體外治療評價。
2、
實驗方法:結合軟件預測,采用固相多肽合成法合成了19種抗菌肽(CP26、P18、CP-P和16種修飾抗菌肽),通過微板法體外比較了其對綠膿桿菌的最小抑菌濃度(MIC)、溶血毒性(MHC)和治療指數(shù)(MHC/MIC),并選取抗菌活性最好的抗菌肽K11S16,進一步檢測其對臨床分離的耐藥菌的最小抑菌濃度及其殺菌的廣譜性。
實驗結果:雜合多肽CP-P與P18相比,具有較好的抗菌活性,對綠膿桿菌(CMCC10104)的最小
3、抑菌濃度為12.5μg/ml。將其兩親性的疏水面和親水面分別用不同的氨基酸取代和修飾的二種多肽(S16,K11S16)不但進一步提高了其抗綠膿桿菌的活性,降低了其溶血毒性,其中K11S16對綠膿桿菌的最小抑菌濃度僅為1.6μg/ml,溶血毒性大于500μg/ml,治療指數(shù)相比P18提高了8倍,相比CP26提高了32倍,結合其對臨床分離耐藥菌的MIC及家兔燒傷模型的治療結果,顯示了較好的臨床應用前景。
第二部分 LAMP抗菌肽數(shù)
4、據(jù)庫的構建
不斷出現(xiàn)的抗生素耐藥菌迫切需要開發(fā)新的抗菌劑。傳統(tǒng)的抗生素開發(fā)方法已經(jīng)難以為繼。抗菌肽作為潛在的抗生素,使得傳統(tǒng)的抗生素開發(fā)方法煥發(fā)新生,這是毋庸置疑的。盡管迄今為止,很多抗菌肽在臨床試驗中都失敗了。一個綜合的,全面的抗菌肽數(shù)據(jù)庫,集成了詳細的抗菌肽抗菌活性和細胞毒性信息,將會加快新的抗菌肽的發(fā)現(xiàn)以及將其轉化進臨床或者臨床前研究的速度。LAMP,一個全新的抗菌肽數(shù)據(jù)庫,用來輔助發(fā)現(xiàn)和設計抗菌肽。當前版本的LAMP數(shù)
5、據(jù)庫共收錄5547條抗菌肽,包括3904條天然抗菌肽和1643條合成抗菌肽。數(shù)據(jù)庫支持通過關鍵詞或者組合條件進行查詢。LAMP擁有詳細的抗菌活性和細胞毒性數(shù)據(jù),實現(xiàn)了交叉連接(cross-linking)和最相關抗菌肽(top similar AMPs)視圖功能,將有助于提高我們對抗菌肽的了解,并最終加速開發(fā)新的抗菌肽藥物。LAMP可以通過http://biotechlab.fudan.edu.cn/database/lamp自由訪問。
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