波譜解析在蛋白質(zhì)組學中的應用與研究.pdf

1、作為生命的物質(zhì)基礎之一，蛋白質(zhì)在催化生命體內(nèi)各種反應進行、調(diào)節(jié)代謝、抵御病原微生物的入侵及控制遺傳信息等方面都起著至關重要的作用。隨著后基因組時代的來臨，蛋白質(zhì)組學已成為國際的主攻領域，是生命科學最重要的研究領域之一。對蛋白質(zhì)組成的分析鑒定是蛋白質(zhì)組學中的主要內(nèi)容，它要求對蛋白質(zhì)組進行表征，即所有蛋白質(zhì)的分離與鑒定及其圖譜化。同時，質(zhì)譜技術的飛速發(fā)展使得MS/MS成為蛋白質(zhì)組學的核心技術，特別是對于蛋白質(zhì)復合物的鑒定、蛋白質(zhì)互聯(lián)網(wǎng)的解析

2、等方面也有著重大的應用。目前，已有多種對串聯(lián)質(zhì)譜與數(shù)據(jù)庫中多肽的理論質(zhì)譜的一致性進行評估的高通量計量算法用于蛋白質(zhì)組學研究中。然而，它們?nèi)源嬖谥@著的多肽鑒定誤差率，因此發(fā)展算法以提高多肽鑒定的準確性仍是目前蛋白質(zhì)組信息學研究的熱點。 因此，首先本文針對蛋白質(zhì)的多組分體系，對投影圖旋轉分析法進行了改進，擴展其應用范圍；其次，對于蛋白質(zhì)的LC-MS/MS串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)，本文結合色譜方向上的保留時間信息，提出了一種結合保留時間信息的串

3、聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)的預處理解析策略，并使用該數(shù)據(jù)預處理解析策略處理實驗測得的數(shù)據(jù)，從而獲得較高的氨基酸序列覆蓋率，提高了蛋白質(zhì)的檢索得分。 本文主要分為三個部分：第一部分為投影圖旋轉分析法在蛋白質(zhì)LC-MS體系中應用。這一部分闡述了投影圖旋轉分析的基本原理及算法，同時針對蛋白質(zhì)多組分分析體系，我們利用超平面的概念對此算法進行了進一步的改進，并對三組分實驗體系和五組分實驗體系進行了分析與討論。 第二部分為串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)的解析與研究。