中國北方漢族人群Dectin-1和DC-SIGN的基因多態(tài)性與真菌性角膜炎的相關(guān)性研究.pdf

1、目的:
　　 探討中國北方漢族人群樹突狀細(xì)胞相關(guān)C型凝集素-1(Dentritic cell associated Ctype lectin-1，Dectin-1)受體基因rs3901532、rs3901533和樹突狀細(xì)胞-特異性細(xì)胞間黏附分子-3結(jié)合非整合素(dendritic cell specific ICAM-3-grabbing non-integrin，DC-SIGN)基因rs735239、rs735240、rs48

2、04803、rs2287886位點(diǎn)多態(tài)性與真菌性角膜炎易感性之間的關(guān)系。
　　 方法:
　　 篩選109例中國北方漢族真菌性角膜炎患者與220例正常對(duì)照者，采用序列特異性引物聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction sequencing，PCR)技術(shù)獲得特定基因目的片段，直接測(cè)序檢測(cè)rs3901532、rs3901533、rs735239、rs735240、rs4804803和rs2287886位

3、點(diǎn)多態(tài)性，結(jié)合臨床資料分析其基因型多態(tài)性分布特征、單倍型分布頻率及其與真菌性角膜炎易感性之間的關(guān)系。采用haploview4.2軟件檢驗(yàn)Hardy-Weinberg平衡確認(rèn)標(biāo)本的群體代表性，并分析各SNP位點(diǎn)之間的連鎖關(guān)系，數(shù)據(jù)分析采用SPSS17.0軟件進(jìn)行卡方檢驗(yàn)和t檢驗(yàn)，等位基因的風(fēng)險(xiǎn)概率以相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)度(OR)和95％可信區(qū)間(95％CI)表示。
　　 結(jié)果:
　　 1.SNPS Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)

4、0正常組的DC-SIGN基因6個(gè)SNPs的基因型均符合Hardy-Weinberg平衡.(HWE)(x2值分別為2.3978、3.5448、0.9188、0.1837、1.1151、2.3530，P值分別為0.1215、0.0597、0.3378、0.6683、0.2910、0.1250)。表明該人群各位點(diǎn)基因型頻率處于平衡狀態(tài)，具有群體代表性。
　　 2.基因型及等位基因頻率比較
　　 對(duì)SNP組成的基因型及等位基因頻

5、率進(jìn)行比較，結(jié)果顯示，病例組和對(duì)照組的Dectin-1 rs3901532、rs3901533和DC-SIGN rs4804803、rs2287886的基因型及等位基因比較無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（基因型分析:x2=0.251，P=0.882; x2=0.105，P=0.949;x2=1.80，P=0.407;x2=1.795，P=0.407。等位基因分析:x2=0.021，P=0.883;x2=0.003，P=0.955;x2=1.870，P=0

6、.171;x2=1.774，P=0.183)。兩組rs735239和rs735240位點(diǎn)的基因型及等位基因比較有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(基因型分析:x2=7.882，P=0.019;x2=6.832，P=0.003。等位基因分析:x2=8.62，P=0.003; x2=6.063，P=0.014)。結(jié)合病情程度及病史分析，病例組與正常對(duì)照組比較無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P＞0.05)。
　　 3.單倍型分析
　　 Dectin-1基因的rs39

7、01532、rs3901533兩個(gè)SNPs位于同一連鎖不平衡區(qū)域內(nèi)(D' statistic=0.991)，構(gòu)成4種單倍型:GT、AG、AT和GG，其中GT和AG兩種單倍型包含了99％以上研究人群，兩組人群的單倍體型分布頻率無顯著差別。DC-SIGN基因的rs4804803、rs2287886兩個(gè)位點(diǎn)位于同一連鎖不平衡區(qū)域內(nèi)(D'statistic=0.952)，有4種單倍型:TT、TC、CC和CT,其中前三種單倍型包含了99％以上研究

8、人群，其中T-C單倍型兩組中分布差別有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(x2=7.19，P=0.007); rs735239和rs735240位于一個(gè)連鎖不平衡區(qū)域，其中單倍體型AG在兩組的分布頻率比較有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(x2=6.06，P=0.014)，G-A在兩組的分布頻率比較有顯著的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(x2=8.62，P=0.003)。其余單倍型分布頻率在兩組中無顯著差異(P＞0.05)。
　　 結(jié)論:
　　 1.DC-SIGN rs735239、r

9、s735240 SNPs與中國北方漢族人群真菌性角膜炎的易感性相關(guān)。Dectin-1 rs3901532、rs3901533和DC-SIGN rs4804803、rs2287886位點(diǎn)多態(tài)性與真菌性角膜炎的易感性無關(guān)。
　　 2.DC-SIGN rs735239和rs735240構(gòu)成的單倍型AG和GA、rs4804803和rs2287886位點(diǎn)構(gòu)成的單倍型TC與真菌性角膜炎易感性相關(guān)。Dectin-lrs3901532和rs39