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文檔簡(jiǎn)介
1、[目的]從埃及伊蚊全基因組序列中識(shí)別絲氨酸蛋白酶抑制劑(Serine Protease Inhibitor,Serpin)基因家族全貌,對(duì)可能在雌蚊體內(nèi)表達(dá)的serpin基因進(jìn)行組織表達(dá)譜分析,為進(jìn)一步探討serpin在蚊蟲與病原相互關(guān)系中的作用奠定基礎(chǔ)。
[方法]對(duì)serpin基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析,用實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR對(duì)雌蚊體內(nèi)serpin基因在中腸、脂肪體、唾液腺等組織表達(dá)譜進(jìn)行分析。
[結(jié)果]
2、 1.在埃及伊蚊基因組中共鑒定出23個(gè)serpin基因,其中4個(gè)基因互為可變剪接。
2.所有序列都含有潛在的酪蛋白激酶Ⅱ(CK2)磷酸化位點(diǎn),蛋白激酶C(PKC)磷酸化位點(diǎn),N-肉豆蔻基位點(diǎn)和天冬酰胺酶糖基化位點(diǎn)。其中的5個(gè)基因序列(2、4、7、9、12)含有潛在的酰胺化位點(diǎn);3個(gè)基因序列(7、11、20)含有潛在的酪氨酸激酶磷酸化位點(diǎn);8個(gè)基因序列(4、5、6、7、12、19、20、21)含有潛在的cAMP依賴的蛋白激酶位點(diǎn)
3、。serpin1含有潛在的咽側(cè)體抑制素位點(diǎn),serpin6含有潛在的VHS結(jié)構(gòu)域,serpin7含有一個(gè)潛在的白蛉病毒核殼(N)蛋白位點(diǎn),serpin25含有潛在的聚集蛋白(NTA:N-terminal agrin)功能域位點(diǎn),serpin14上發(fā)現(xiàn)含有潛在的“RGD”模體。
3.氨基酸序列比對(duì)結(jié)果顯示,P1位置的氨基酸具有豐富的多樣性,有12種不同的氨基酸(K、T、I、S、R、M、C、L、A、P、N、V),其中為帶電荷堿性氨
4、基酸(R、K)的serpin基因共有10個(gè),分別是:serpin1、2、8、14、23A、23B具有賴氨酸(K);serpin7、10D、20、21、22具有精氨酸(R)。
4.構(gòu)建埃及伊蚊serpin基因家族在雌蚊唾液腺、脂肪體、中腸的組織表達(dá)譜。結(jié)果顯示,除了serpin21、24、26組織表達(dá)差異無明顯統(tǒng)計(jì)學(xué)意義外,其它18個(gè)基因在三個(gè)組織的表達(dá)差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。其中在唾液腺高表達(dá)的基因共有11個(gè),在中腸高表達(dá)的基因有
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