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文檔簡介
1、微孢子蟲是一類專性細(xì)胞內(nèi)寄生的病原微生物,它能寄生于包括人在內(nèi)幾乎所有的動(dòng)物體內(nèi)。家蠶微孢子蟲能感染家蠶引起家蠶微粒子病,是蠶業(yè)生產(chǎn)上一種重點(diǎn)控制的蠶病。家蠶微孢子蟲蛋白質(zhì)組學(xué)研究以總蛋白為研究對象,主要采用雙向電泳技術(shù)、質(zhì)譜技術(shù)以及生物信息學(xué)技術(shù),獲得家蠶微孢子蟲蛋白質(zhì)雙向電泳參考圖,通過質(zhì)譜分析,鑒定蛋白質(zhì),以期找到與微孢子蟲侵染、增殖及代謝等重妻生理過程相關(guān)的蛋白質(zhì),為家蠶微孢子蟲的基礎(chǔ)研究積累更多的知識。 1.成熟家蠶微
2、孢子蟲總蛋白提取方法的建立。提取家蠶微孢子蟲蛋白質(zhì)的方法主要有化學(xué)與物理的方法,化學(xué)方法是利用0.1mol/LK<,2>CO<,3>溶液在27℃條件下刺激微孢子蟲彈出極管,釋放出的孢原質(zhì)破裂,然后獲取蛋白質(zhì),此方法簡單且提取的蛋白質(zhì)含量較豐富,但樣品中含有大量的鹽離子。物理方法主要是采用液氮反復(fù)凍融結(jié)合研磨,破碎幾丁質(zhì)外壁,用蛋白質(zhì)抽提液抽提,從而得到蛋白質(zhì),此方法較煩瑣,但得到的蛋白質(zhì)含量豐富且樣品中鹽離子濃度極低,適用于雙向電泳,且
3、電泳效果較好。 2.家蠶微孢子蟲雙向電泳參考圖譜的建立。通過雙向電泳,我們得到一張比較完整的家蠶微孢子蟲蛋白質(zhì)圖譜,通過Image master軟件分析,可識別的蛋白點(diǎn)有267個(gè)。多數(shù)蛋白質(zhì)分子量集中在45KD以下,各pH段都有分布,小分子量蛋白質(zhì)種類豐富,而大分子量的蛋白質(zhì)含量較少,特別是堿性區(qū)域的大分子量蛋白質(zhì)極少。 3.家蠶微孢子蟲本地蛋白質(zhì)檢索數(shù)據(jù)庫的建立及蛋白質(zhì)譜鑒定。根據(jù)家蠶微孢子蟲全基因組數(shù)據(jù)預(yù)測出的編碼序
4、列,利用GPMAW軟件,建立本地蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫。從雙向電泳圖譜共挖點(diǎn)295個(gè)(包括重復(fù)挖點(diǎn)),通過MALDI-TOF-MS鑒定出的蛋白質(zhì)點(diǎn)有80個(gè),除去重復(fù)后的蛋白質(zhì)點(diǎn)有50個(gè),其中有功能信息的蛋白質(zhì)有28個(gè),hypothetical protein有9個(gè),未知蛋白有13個(gè)。對有功能信息的蛋白質(zhì)進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)其功能涉及到微孢子蟲的基本生理活動(dòng),包括蛋白質(zhì)代謝、轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)座、細(xì)胞骨架、細(xì)胞修復(fù)、死亡、老化、細(xì)胞生長、胞內(nèi)信號傳導(dǎo)、蛋白質(zhì)合成等
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