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文檔簡介
1、第一部分:CTLA—4基因多態(tài)性與Vogt—小柳原田綜合征的相關(guān)性研究 目的:Vogt—小柳原田(Vogt—Koyanagi—HaradaSyndrome,VKH)綜合征是一種累及全身多個系統(tǒng)、多個器官的自身免疫性疾病,典型表現(xiàn)為雙眼的全葡萄膜炎、白癜風(fēng)、脫發(fā)、毛發(fā)變白以及中樞神經(jīng)系統(tǒng)癥狀。細胞毒性T淋巴細胞相關(guān)抗原—4(cytotoxicTlymphocyte—associatedantigen—4,CTLA—4)是一T細胞介
2、導(dǎo)免疫反應(yīng)的負性調(diào)節(jié)因子,研究發(fā)現(xiàn)其基因多態(tài)與多種自身免疫性疾病相關(guān)。本實驗的目的是探討CTLA—4基因的4個單核甘酸多態(tài)(SingleNucleotidePolymorphism,SNP)與中國漢族人群VKH綜合征的相關(guān)性。 方法:選擇中國漢族人群209例VKH綜合征患者和256例健康對照者,采集外周靜脈血2-5ml,抗凝處理,提取基因組DNA,運用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PolymeraseChainReaction,PCR)—限制
3、性片段長度多態(tài)性(RestrictionFragmentLengthPolymorphism,RFLP)的方法,檢測CTLA—4基因的4個SNP位點(-1661A/G,rs4553808;—318C/T,rs5742909;+49G/A,rs231775;及CT60,rs3087243),用SPSS10.0軟件進行統(tǒng)計學(xué)分析,探討上述4個SNP的多態(tài)性與中國漢族人群VKH綜合征的相關(guān)性;用Haploview3.32軟件以這4個SNP位點
4、構(gòu)建CTLA—4基因單倍體型,并比較VKH綜合征和健康對照兩人群中CTLA—4個單倍體型的頻率差異。 結(jié)果: 1.CTLA—4基因+49G/A位點的G等位基因在VKH綜合征患者中的頻率顯著高于健康對照(71.6%vs62.8%,p=0.0046,pcorrected=0.037,OR=1.141);該多態(tài)位點的基因型在VKH綜合征患者和健康對照中的頻率無差異(p=0.01,pcorrected=0.12)。 2.
5、CTLA—4基因CT60位點的G等位基因在VKH綜合征患者中的頻率較健康對照組升高(81.8%vs76.4%,p=0.043),但經(jīng)Bonferroni校正后差異無統(tǒng)計學(xué)意義;該多態(tài)位點基因型的頻率在VKH綜合征患者和健康對照中的差異無統(tǒng)計學(xué)意義(p=0.016,pcorrected=0.192)。 3.CTLA—4基因-1661A/G位點和—318C/T位點的等位基因及基因型頻率在VKH綜合征患者與健康對照中頻率的差異無統(tǒng)計學(xué)
6、意義。 4.利用Haploview3.32軟件以這4個位點構(gòu)建CTLA—4基因單倍體型,有3個單倍體型的頻率在VKH綜合征患者和/或健康對照中大于3%。單倍體型-1661A:—318C:+49G:CT60G在VKH綜合征患者和健康對照組中的頻率均最高,并且該單倍體型在VKH綜合征患者中的頻率顯著高于健康對照組(70.1%vs60.0%,p=0.0013,pcorrected=0.021,OR=1.565)。單倍體型-1661A:
7、—318C:+49A:CT60A在VKH綜合征患者中的頻率較健康對照低,但經(jīng)Bonferroni校正后差異無統(tǒng)計學(xué)意義(15.7%vs21.2%,p=0.0349,porrected=0.584,OR=0.701). 結(jié)論:CTLA—4基因SNP+49G/A位點的G等位基因和CTLA—4單倍體型-1661A:—318C:+49G:CT60G與VKH綜合征的易感性相關(guān),提示CTLA—4的多態(tài)性與中國漢族VKH綜合征易感性相關(guān)。
8、 第二部分:CTLA—4基因多態(tài)性與Behcet病的相關(guān)性研究 目的:Behcet病是一種自身免疫性疾病,典型表現(xiàn)為復(fù)發(fā)性口腔潰瘍、生殖器潰瘍和復(fù)發(fā)性葡萄膜炎三聯(lián)征和皮膚病變的,是我國最常見和最重要的致盲性葡萄膜炎之一。本實驗的目的是探討CTLA—4基因的4個SNP與中國漢族人群Behcet病的相關(guān)性,并利用薈萃分析(meta—analysis)探討CTLA—4基因SNP+49G/A位點多態(tài)性與Behcet病的相關(guān)性。
9、 方法:選擇漢族人群228例Behcet病患者和207例健康對照者,采集外周靜脈血2-5ml,抗凝處理,抽提基因組DNA,運用PCR—RFLP檢測CTLA—4基因的4個SNP位點(-1661A/G,rs4553808;—318C/T,rs5742909;+49G/A,rs231775;和CT60,rs3087243),用SPSS10.0軟件進行統(tǒng)計學(xué)分析,探討上述4個SNP的多態(tài)性與漢族人群Behcet病的相關(guān)性;用Haploview
10、3.32軟件以者這4個SNP位點構(gòu)建CTLA—4單倍體型,并在Behcet病和健康對照兩人群中比較CTLA—4個單倍體型頻率的差異。檢索CTLA—4基因多態(tài)與Behcet病相關(guān)性研究的文獻,利用薈萃分析評價CTLA—4基因SNP+49G/A位點多態(tài)性與Behcet病的相關(guān)性。 結(jié)果: 1.CTLA—4基因4個SNP多態(tài)(-1661A/G、—318C/T、+49G/A和CT60)的等位基因頻率和基因型的頻率在中國漢族Beh
11、cet病患者和健康對照組中的差異無統(tǒng)計學(xué)意義。 2.利用Haploview3.32軟件以這4個位點構(gòu)建CTLA—4基因單倍體型,有3個單倍體型的頻率在Behcet病患者和/或健康對照中大于3%。單倍體型-1661A:—318C:+49G:CT60G在Behcet病患者和健康對照組中的頻率均最高,但各個單倍體型的頻率在Behcet病患者中與健康對照組的差異無統(tǒng)計學(xué)意義。 3.根據(jù)Medline檢索的3篇關(guān)于CTLA—4基因
12、SNP+49G/A多態(tài)與Behcet病相關(guān)性研究的文獻數(shù)據(jù)以及本實驗的數(shù)據(jù),薈萃分析結(jié)果顯示所有4個實驗結(jié)果無異質(zhì)性(p=0.60,I2=0%),CTLA—4基因SNP+49G/A多態(tài)性與Behcet病無相關(guān)性(overalleffects:Z=0.26,p=0.79),集合危險系數(shù)(pooledOR)為0.98(0.83-1.15)。 結(jié)論:實驗研究提示CTLA—4基因多態(tài)性與漢族Behcet病無相關(guān)性。薈萃分析結(jié)果顯示CTL
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