基于QTL區(qū)域影響豬妊娠期長短性狀的分子標(biāo)記的研究.pdf

1、繁殖性狀是非常重要的經(jīng)濟性狀，妊娠期短的母豬可以縮短繁殖周期，加快繁殖頻率，提高其生產(chǎn)能力，而且還可以節(jié)省妊娠飼料。根據(jù)國內(nèi)外報道的QTL定位結(jié)果、豬-人比較圖譜以及基因的生理生化功能，分別選取了三個影響妊娠期長短的候選基因HSD11B1(11 β hydroxysteroid dehydrogenase-1，11β-羥基類固醇脫氫酶1)，PGHS2(prostaglandin H synthase-2，前列腺素H合成酶2)和MyoG(

2、myogenin，肌細(xì)胞生成素)。應(yīng)用比較基因組學(xué)、生物信息學(xué)等方法分離鑒定了這些基因，并以清平豬、新清平母系(由清平豬與杜洛克豬雜交形成的品系)、長白豬、大白豬、杜洛克豬、中國瘦肉豬新品系DⅣ<,1>系、DⅣ<,2>系為材料，研究了這些基因的多態(tài)性位點與豬繁殖性狀的相關(guān)性。具體結(jié)果如下： 一、HSD11B1基因的遺傳效應(yīng)分析結(jié)果： 1)獲得清平豬，新清平豬，大白豬，杜洛克豬HSD11B1基因部分基因組序列。經(jīng)比對分析在

3、不同品種豬基因組擴增序列中檢測到22個SNPs，在3’端的一處G/A轉(zhuǎn)換的SNP引起了Bshl236 Ⅰ酶切多態(tài)性，建立了該位點的PCR-Bshl236 Ⅰ-RFLP基因分型方法。 2)在7個不同品種品系中檢測了HSD11B1基因Bshl236 Ⅰ-RFLP基因型頻率和等位基因頻率分布，發(fā)現(xiàn)清平豬與新清平豬的B等位基因頻率比其他豬種的高，x<'2>檢驗結(jié)果表明等位基因頻率在清平豬和其他豬群之間存在顯著或極顯著差異。 3)

4、在清平豬、新清平母豬、長白豬、大白豬、中國瘦肉豬新品系DⅣ<,1>、DⅣ<,2>中進行HSD11B1基因Bshl236 Ⅰ-RFLP標(biāo)記與繁殖性狀的關(guān)聯(lián)分析，結(jié)果表明該位點在母豬中BB型比AA型的妊娠期要短，并在初產(chǎn)中國瘦肉豬新品系DⅣ<,1>妊娠期中表現(xiàn)差異顯著(P<0.05)，加性效應(yīng)顯著(P<0.05)。 二、MyoG基因的遺傳效應(yīng)分析結(jié)果： 1)在7個不同品種品系中檢測了MyoG基因Msp Ⅰ-RFLP基因型頻率

5、和等位基因頻率分布，發(fā)現(xiàn)在清平豬中只有MM基因型，在杜洛克中’NN型占大多數(shù)，x<'2>檢驗結(jié)果表明等位基因頻率在清平豬和其他豬群之間存在極顯著差異。 2)在新清平母豬、長白豬、大白豬、杜洛克豬、中國瘦肉豬新品系DⅣ<,1>、DⅣ<,2>中進行myoG基因Msp Ⅰ-RFLP標(biāo)記與妊娠期性狀的關(guān)聯(lián)分析，結(jié)果表明該位點在母豬中MM型比NN型的妊娠期要短，并在長白豬經(jīng)產(chǎn)妊娠期中表現(xiàn)差異極顯著(P<0.01)，且加性效應(yīng)極顯著(P<0

6、.01)。 3)在新清平母豬、長白豬、大白豬、杜洛克豬、中國瘦肉豬新品系DⅣ<,1>、DⅣ<,2>中進行MyoG基因Msp Ⅰ-RFLP標(biāo)記與產(chǎn)仔數(shù)性狀的關(guān)聯(lián)分析，結(jié)果表明該位點在母豬中NN型比MM型的產(chǎn)仔數(shù)要多，但是在個別群體中表現(xiàn)差異不顯著(P>0.05)。 三、PGHS2基因的遺傳效應(yīng)分析結(jié)果： 1)獲得清平豬，新清平豬，大白豬，杜洛克豬PGHS2基因部分基因組序列。經(jīng)比對分析在不同品種豬基因組擴增序列中發(fā)

7、現(xiàn)，在第8外顯子存在一個A/G轉(zhuǎn)換，建立了該位點的PCR-SSCP基因分型方法。 2)在7個不同品種品系中檢測了PGHS2基因型頻率和等位基因頻率分布，發(fā)現(xiàn)清平豬與新清平豬的B等位基因頻率比其他豬種的高，x<'2>檢驗結(jié)果表明等位基因頻率在新清平豬和一些豬群之間存在顯著或極顯著差異。 3)在清平豬、新清平母豬、長白豬、大白豬和杜洛克豬中進行PGHS2基因SSCP標(biāo)記與妊娠期性狀的關(guān)聯(lián)分析，結(jié)果表明該位點在母豬中BB型比A