自身抗體譜檢測數(shù)據(jù)挖掘與報(bào)告解讀.pdf

1、目的：回顧分析自身抗體譜(autoantibodies，AAB)檢測結(jié)果，探討抗核抗體(ANA)、抗核糖核蛋白抗體（nRNP/Sm）、抗Sm抗體(Sm)、抗干燥綜合征A抗體(SSA)、抗干燥綜合征Ro-52抗體(Ro-52)、抗干燥綜合征B抗體(SSB)、抗拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ抗體（Scl-70）、抗PM-Scl抗體(PM-Scl)、抗細(xì)胞漿組酰-tRNA合成酶抗體(Jo-1)、抗著絲點(diǎn)抗體B(CENP B)、抗增殖細(xì)胞核抗原抗體(PCNA)、

2、抗雙鏈DNA抗體(ds-DNA)、抗核小體抗體(Nuclesome)、抗組蛋白抗體(Histone)、抗核糖體P蛋白抗體（Rib·P）和抗線粒體M2抗體（AMA-M2）等自身抗體的陽性分布趨勢和在疾病中的臨床意義，評估16種自身抗體對自身免疫性疾病(AID)的診斷效率，通過數(shù)據(jù)挖掘(data mining)，探尋自身抗體的診斷程序，建立自身免疫性疾病的診斷模型，為自身抗體譜檢驗(yàn)報(bào)告的規(guī)范化和標(biāo)準(zhǔn)化解讀以及臨床診療決策提供參考依據(jù)，提高自

3、身免疫性疾病的診斷效率。
　　方法：通過醫(yī)院信息平臺(tái)檢索并統(tǒng)計(jì)自2013年1月-2014年9月我院自身抗體譜檢測結(jié)果共計(jì)9585份，納入研究8904份，其中確診為系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE)668份，占7.5％;確診為SLE以外的其他AID1279份，占14.4％;非AID6957份，占78.1％。共排除681份。結(jié)合患者臨床信息分析自身抗體譜在不同性別、年齡組（≤20歲組、21～49歲組、≥50歲組））和疾病組（SLE組、AID對照

4、組、非AID對照組）中的陽性分布，以及各種自身免疫性疾病構(gòu)成比（即就診人群發(fā)病率）。采用SPSS17.0軟件ROC分析計(jì)算各自身抗體ROC曲線下面積(AUC)，評估其對自身免疫性疾病的診斷效率。采用系統(tǒng)聚類法對項(xiàng)目變量和標(biāo)本個(gè)案進(jìn)行聚類，分析各自身抗體間內(nèi)在相似程度，比較聚類分群與臨床分組的一致性。分別采用決策樹、Logstic回歸和人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(ANN)建立SLE和AID診斷模型并進(jìn)行盲法驗(yàn)證，比較三種模型的診斷效能，選擇最優(yōu)模型，擴(kuò)

5、展ROC數(shù)據(jù)集，采用驗(yàn)后概率、誤診率和漏診率解讀自身抗體譜檢驗(yàn)報(bào)告。
　　結(jié)果：1.ANA、nRNP/Sm、Sm、SSA、Ro-52、SSB、Scl-70、PM-Scl、Jo-1、CENP B、PCNA、ds-DNA、Nuclesome、Histone、Rib·P和AMA-M2在8904例就診人群中的陽性率分別為24.4％、8.4％、3.0％、16.1％、12.1％、3.5％、2.0％、2.1％、1.7％、2.3％、4.6％、4.

6、3％、3.6％、7.6％、4.6％和3.4％。除Scl-70，PM-Scl，Jo-1和PCNA外，其余自身抗體在女性中的陽性率顯著高于男性(P＜0.001)。12種自身抗體（除PM-Scl、Jo-1、PCNA和AMA-M2）在三個(gè)年齡組的陽性率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P＜0.001)。在SLE組，除Jo-1、CENP B和Scl-70外，自身抗體的陽性率均顯著高于兩個(gè)疾病對照組(P＜0.05)， AID對照組中所有自身抗體的陽性率均高于非AI

7、D對照組。自身免疫性疾病和SLE在9595例就診人群中發(fā)病率分別為20.3％和6.96％。2.性別、年齡和16種自身抗體對SLE診斷鑒別的ROC曲線下面積(AUC)大小依次為:ANA(0.889)＞ SSA(0.821)＞nRNP/Sm(0.774)＞Ro-52(0.735)＞ Histone(0.704)＞ Nuclesome(0.692)＞Rib·P(0.685)＞ds-DNA(0.662)＞性別(0.640)＞Sm(0.638)＞

8、SSB(0.579)＞AMA-M2(0.537)(P＜0.001)，年齡指標(biāo)的ROC曲線在對角線參考線以下，AUC為0.330(P＜0.001)，而Scl-70、PM-Scl、Jo-1、CENP B和PCNA沒有顯著性意義(P＞0.05)。3.變量聚類中，ANA、SSA、Ro-52和SSB四項(xiàng)聚為一類;nRNP/Sm、Sm、 ds-DNA、Nuclesome、Histone和Rib·P六項(xiàng)聚為一類;CENP B和AMA-2聚為一類;性別

9、、年齡、 Scl-70、PM-Scl、Jo-1、CENP B、PCNA和AMA-M2各為一類，分別與其他自身抗體的距離相對較遠(yuǎn)。標(biāo)本聚類與臨床分組的相關(guān)系數(shù)r=0.603，一致性度量Kappa=0.476，(P＜0.001)，二者之間具有一般相關(guān)性。4.經(jīng)盲法驗(yàn)證，Logstic模型診斷SLE的靈敏度為81.2％，特異性為97.6％，陽性預(yù)測值為73.5％，陰性預(yù)測值為98.4％，準(zhǔn)確度為96.4％，各項(xiàng)性能指標(biāo)均略高于決策樹和ANN模

10、型。Logstic模型診斷SLE(AID)的AUC為0.963(0.872)，明顯高于決策樹模型和ANN模型，差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P＜0.05)。故優(yōu)選Logstic模型作為SLE和AID最佳診斷模型，采用驗(yàn)后概率、漏診率、誤診率等指標(biāo)擴(kuò)展Logstic預(yù)測值ROC數(shù)據(jù)集，作為臨床疾病診斷和自身抗體譜報(bào)告解讀的參考依據(jù)，具有較好的指導(dǎo)意義。
　　結(jié)論：數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)用于自身抗體譜檢測數(shù)據(jù)的分析和處理，可將有限的數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)變?yōu)楦咝У脑\治信息