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文檔簡介
1、本研究根據(jù)瓜類病原細菌可溶性蛋白的特異性,建立鑒定瓜類細菌性果斑病菌(Acidovoraxavenaesubsp.citrulli,簡稱A.a.c)的SDS-PAGE方法,根據(jù)SDS-PAGE圖譜直接鑒定出瓜類細菌性果斑病原菌,為植物檢疫部門檢測該類病菌提供一種快速、準確的方法。 利用細菌16SrDNA基因的通用引物對供試菌株進行PCR擴增,對擴增產物進行核苷酸序列測定。將獲得的序列與GenBank中相關菌株的16SrDNA序列
2、進行同源性分析。利用最大簡約法構建了16SrDNA系統(tǒng)演化樹,并設計出檢測A.a.c的特異性引物。利用設計的特異性引物(BFB64/65)對各供試菌株進行PCR檢測,結果只有A.a.c菌株產生擴增泳帶,產物大小與預期一致。因此,構建了快速檢測A.a.c病菌的PCR方法。 根據(jù)瓜類細菌性果斑病菌與相關細菌16SrDNA序列差異,設計出對A.a.c具有穩(wěn)定點突變特異性探針Aac-probe,利用該探針對供試菌株進行了實時熒光PCR檢
3、測試驗。結果表明,除瓜類細菌性果斑病菌能檢測到熒光增強信號外,其余菌株無熒光增強信號。實時熒光PCR的相對靈敏度明顯高于常規(guī)PCR,表現(xiàn)出特異性強,靈敏度高,重復性好,可有效地應用于A.a.c菌的檢測。 本研究首次構建瓜類細菌性果斑病菌可溶性蛋白的SDS-PAGE檢測方法;首次對A.a.c菌株16SrDNA序列進行同源性分析,建立其在細菌系統(tǒng)演化樹上的分類地位;首次對實時熒光PCR體系進行優(yōu)化,建立了對A.a.c的TaqMan實
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