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文檔簡介
1、本文主要從以下幾個方面展開論述:
第一部分 CYP17基因多態(tài)性與復(fù)發(fā)性自然流產(chǎn)(RSA)的關(guān)聯(lián)性研究
目的:本研究對細(xì)胞色素氧化酶P450c17a(cytochrome P450c17a,CYP17)基因的rs743572(T/C), rs6162(C/T), rs6163(G/T)三個多態(tài)性位點進(jìn)行檢測,探討CYP17基因三個多態(tài)性位點及其單倍型與寧夏漢族復(fù)發(fā)性自然流產(chǎn)(RSA)的相關(guān)性。
方法:病例組
2、選取2009年1月-2011年12月在寧夏醫(yī)科大學(xué)生殖與遺傳重點實驗室進(jìn)行染色體檢查的復(fù)發(fā)性自然流產(chǎn)患者160例;對照組選取與病例組年齡等相匹配的2009年1月-2011年12月在寧夏銀川市婦幼保健院正常分娩的女性169例。采用聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)技術(shù)對病例組與對照組的目的片段進(jìn)行擴(kuò)增,通過焦磷酸測序技術(shù)(pyrosequencing)對CYP17基因擴(kuò)增片段中的三個多態(tài)性位點進(jìn)行基
3、因分型。用 SPSS16.0統(tǒng)計軟件進(jìn)行卡方檢驗及疾病相對危險度的估計,計算和比較各組基因型頻率、等位基因頻率、比值比(OR)及95%可信區(qū)間(95%CI),分析CYP17基因三個SNPs位點與復(fù)發(fā)性自然流產(chǎn)的相關(guān)性,用Haploview軟件進(jìn)行單倍型構(gòu)建來探討CYP17基因的三個SNPs位點與復(fù)發(fā)性自然流產(chǎn)的易感性是否有關(guān)聯(lián)。
結(jié)果:1、經(jīng)遺傳平衡定律檢驗,CYP17基因三個多態(tài)性位點各基因型頻率分布均符合Hardy-Wei
4、nberg平衡法則,具有群體代表性。2、CYP17基因rs743572(T/C)、rs6162(C/T)、和rs6163三個多態(tài)性位點基因型和等位基因頻率在病例組與對照組中的分布頻率差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05);三個位點的隱性基因模型和顯性基因模型在病例組與對照組中的分布頻率顯著性差異不明顯(P>0.05)。3、CYP17基因三個SNPs位點之間,rs743572和rs6162、rs6162和rs6163、rs743572和rs6
5、163之間為高度連鎖不平衡(D’>0.7)。4、CYP17基因rs743572、rs6162和rs6163三個單核苷酸多態(tài)性位點相互構(gòu)建的單倍型共18種,其中頻率大于0.03的有8種(A-C、G-T、T-T、G-C、T-C、C-T、T-T-C、G-C-T)。rs6163、rs6162、rs743572三個多態(tài)性位點兩兩構(gòu)建的單倍型中:各單倍型頻率在病例組與對照組中的差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05);三個多態(tài)性位點rs6163-rs616
6、2-rs743572構(gòu)建的單倍型數(shù)據(jù)顯示:各單倍型頻率在病例組與對照組中的差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。
結(jié)論:1、CYP17基因rs743572、rs6162、rs6163三個多態(tài)性位點各基因型頻率和等位基因頻率在病例組與對照組中的分布均無統(tǒng)計學(xué)意義,可能與寧夏漢族女性復(fù)發(fā)性自然流產(chǎn)的易感性無關(guān)。2、CYP17基因三個SNPs位點兩兩之間存在高度連鎖不平衡。3、CYP17基因構(gòu)建的單倍型中,各單倍型在病例組與對照組中的分
7、布均無統(tǒng)計學(xué)意義,可能與寧夏漢族女性復(fù)發(fā)性自然流產(chǎn)的易感性無關(guān)。
第二部分 CYP17基因多態(tài)性與復(fù)發(fā)性自然流產(chǎn)易感性關(guān)系的Meta分析
目的:探討CYP17基因rs743572 T→C單核苷酸多態(tài)性位點與復(fù)發(fā)性自然流產(chǎn)易感性之間是否存在相關(guān)性。
方法:檢索PubMed、中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(CBM)、中國期刊全文數(shù)據(jù)庫(CNKI)、等數(shù)據(jù)庫。檢索國內(nèi)外公開發(fā)表的CYP17基因rs743572(T→C)單
8、核苷酸多態(tài)性位點與復(fù)發(fā)性自然流產(chǎn)易感性關(guān)系的研究。以病例組及對照組CYP17基因(T→C)等位基因分布的比值比(OR)為效應(yīng)指標(biāo),應(yīng)用Review Manager5.2統(tǒng)計軟件根據(jù)異質(zhì)性檢驗結(jié)果選擇隨機(jī)效應(yīng)模型或固定效應(yīng)模型對OR進(jìn)行合并分析,對不同納入標(biāo)準(zhǔn)的結(jié)果進(jìn)行敏感性分析,用漏斗圖評估發(fā)表性偏倚。
結(jié)果:最終納入分析文獻(xiàn)6篇,病例組745例,對照組756例。顯性模式下:以野生純合子TT為參照評估突變純合子和雜合子(CC+
9、TC)患復(fù)發(fā)性自然流產(chǎn)的風(fēng)險,異質(zhì)性檢驗結(jié)果顯示Pheterogeneity=0.01,存在顯著異質(zhì)性,故采用隨機(jī)效應(yīng)模型進(jìn)行合并,Meta分析結(jié)果顯示:突變純合子和雜合子(CC+TC)在病例組和對照組中無顯著差異性(OR=1.42,95%CI=0.96-2.10,Z=1.75,P=0.08);隱形模式下:以野生純合子和雜合子(TT+TC)為參照評估突變純合子CC患復(fù)發(fā)性自然流產(chǎn)的風(fēng)險,異質(zhì)性檢驗結(jié)果顯示P heterogeneity=
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