丹參和三七治療冠心病多靶點(diǎn)作用的計(jì)算研究.pdf

1、丹參和三七為臨床常用藥對(duì)，在國(guó)內(nèi)外，二者被廣泛地結(jié)合用于治療冠心病、心絞痛等心血管疾病。研究表明，丹參和三七具有擴(kuò)張冠狀動(dòng)脈血管、增加動(dòng)脈血流量、激活超氧化歧化酶等藥理功效。然而，二者治療冠心病的分子機(jī)制目前尚不十分清楚。本課題采用計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)的方法來(lái)研究丹參和三七有效成分與冠心病靶點(diǎn)的相互作用，以期初步探討丹參和三七治療冠心病的作用機(jī)制。
　　結(jié)合相關(guān)藥理實(shí)驗(yàn)報(bào)道，我們一共挑選31個(gè)活性成分來(lái)組建化學(xué)成分?jǐn)?shù)據(jù)庫(kù)，其中17個(gè)

2、化合物來(lái)自丹參，14個(gè)化合物來(lái)自三七。同時(shí)，通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)搜索、同源模建以及活性位點(diǎn)搜尋等方法，我們建立了一個(gè)冠心病相關(guān)靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù)。該數(shù)據(jù)庫(kù)由63個(gè)活性位點(diǎn)已知的蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)組成，其中41個(gè)靶蛋白的具有高分辨率的晶體結(jié)構(gòu)從數(shù)據(jù)庫(kù)RCSB中下載得到，另外22個(gè)靶蛋白的三維模型通過(guò)同源模建的方法獲得。
　　我們利用分子對(duì)接方法來(lái)研究丹參和三七化學(xué)成分與冠心病靶點(diǎn)的相互作用。31個(gè)化學(xué)成分分別對(duì)接到63個(gè)靶蛋白的活性口袋中。結(jié)果顯示，有1

3、6個(gè)化學(xué)成分可作用于34個(gè)以上的靶點(diǎn)。其中，丹酚酸A、B、E、J、L、迷迭香酸、紫草酸、人參皂苷Rh1和槲皮素-3-O-槐糖苷9個(gè)化合物可以作用于至少45個(gè)靶點(diǎn)，它們可能是丹參和三七在治療冠心病中發(fā)揮作用的主要成分。同樣，冠心病相關(guān)靶點(diǎn)也展示出較好的網(wǎng)絡(luò)性。有36個(gè)靶標(biāo)的平均化合物數(shù)目在15個(gè)以上，它們可能是丹參和三七在治療冠心病方面主要針對(duì)的靶點(diǎn)。計(jì)算結(jié)果表明，丹參和三七通過(guò)不同的化學(xué)成分協(xié)同作用于冠心病相關(guān)的多個(gè)靶點(diǎn)，二者相互促進(jìn)，

4、相互補(bǔ)充。它們可能通過(guò)調(diào)節(jié)脂質(zhì)代謝、保護(hù)血管內(nèi)皮細(xì)胞、抑制血栓形成、調(diào)節(jié)血壓多個(gè)方面來(lái)實(shí)現(xiàn)治療冠心病的目的。
　　另外，計(jì)算結(jié)果預(yù)測(cè)有17個(gè)化合物對(duì)相關(guān)靶點(diǎn)的潛在作用屬于高活性水平，我們分析了這些化合物與其靶點(diǎn)間的相互作用，為將來(lái)先導(dǎo)化合物的發(fā)現(xiàn)與優(yōu)化提供了一定的基礎(chǔ)。
　　本課題有關(guān)丹參和三七化學(xué)成分與冠心病靶點(diǎn)相互作用研究的方法以及結(jié)論，可以為將來(lái)從分子水平探討丹參和三七治療冠心病的作用機(jī)制以及發(fā)現(xiàn)新的先導(dǎo)化合物提供一定