基因芯片平臺(tái)的建立及在APL細(xì)胞分化研究中的應(yīng)用.pdf

1、為了更好地在轉(zhuǎn)錄組水平研究疾病的發(fā)病機(jī)制,我們建立了cDNA基因芯片技術(shù)平臺(tái),現(xiàn)在已有12,630個(gè)克隆,已知基因有9,436個(gè).在平臺(tái)的質(zhì)量上,片內(nèi)和片間的信號(hào)強(qiáng)度的相關(guān)系數(shù)達(dá)到0.95,且芯片的結(jié)果與實(shí)時(shí)定量RT-PCR的結(jié)果一致性好,說(shuō)明我們的平臺(tái)是穩(wěn)定的可靠的平臺(tái).為了進(jìn)一步研究維甲酸誘導(dǎo)分化的機(jī)制該文應(yīng)用cDNA基因芯片技術(shù),結(jié)合自組成圖(SOM)與成分平面展示等生物信息手段,分析了藥理濃度的ATRA誘導(dǎo)NB4細(xì)胞分化不同時(shí)相

2、(6h、12h、24h、和48h)的基因表達(dá)譜.該文著重分析了C/EBP家族和bHLH家族的轉(zhuǎn)錄因子的變化情況,C/EBPα在ATPA作用后表達(dá)略微上升,隨著向粒系終末分化表達(dá)發(fā)生了下降,而C/EBPβ和C/EBPε在ATPA作用后表達(dá)持續(xù)上升,它們變化的不同與這些C/EBP蛋白行使的功能不同相一致.綜 上所述,在藥理濃度ATRA作用下,APL細(xì)胞中的維甲酸受體通路重新被激活,許多基因的表達(dá)發(fā)生了變化,這些基因形成了一個(gè)復(fù)雜且有序的調(diào)控