湖南大圍子豬SLA-DR基因克隆及其生物信息學(xué)分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:克隆湖南大圍子豬SLA-DR基因,生物信息學(xué)分析其免疫學(xué)特性,評價該豬種在異種器官移植中是否具有應(yīng)用前景,為篩選異種移植候選供體提供免疫學(xué)依據(jù)。
　　 方法:應(yīng)用RT-PCR擴增大圍子豬SLA-DRA和SLA-DRB基因,插入pUCM-T載體,雙向測序,用NCBI中的BLAST和ExPASY等軟件進行生物信息學(xué)分析。
　　 結(jié)果:大圍子豬SLA-DRA和SLA-DRB基因擴增片段大小分別為1177 bp和909 b

2、p,均包含完整的開放閱讀框,分別編碼252和266個氨基酸殘基。大圍子豬SLA-DRA和SLA-DRB與人類相應(yīng)的DRA、DRB相比,氨基酸同源性分別為82％和73％。SLA DRα鏈與人CD4分子結(jié)合部位介于第124至136位氨基酸,大圍子豬SLA-DRA在該結(jié)合區(qū)域與人類相應(yīng)的DRA存在兩個氨基酸差異,即:第127位(Val→lle),第136位(Thr→Ser)；SLA DRβ鏈與人CD4分子結(jié)合部位位于第134至148位氨基酸,

3、大圍子豬SLA-DRB在該結(jié)合區(qū)域與人類相應(yīng)的DRB相比氨基酸序列完全相同。與國際GenBank已登錄的許多豬種相比,SLA-DRA基因同源性高達100％,而SLA-DRB基因在各豬種之間具有很高的多態(tài)性,種系進化樹結(jié)果表明大圍子豬與中國小型版納豬及五指山豬親緣關(guān)系較近。
　　 結(jié)論:克隆湖南大圍子豬SLA-DRA和SLA-DRB基因,生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)該基因與人類相應(yīng)的HLA-DRA和HLA-DRB基因高度同源,提示該豬種有望

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