棉花纖維發(fā)育相關(guān)基因時空表達(dá)及其生物信息學(xué)分析.pdf

1、棉花纖維作為世界上重要的天然纖維原料，其在紡織工業(yè)的重要性不言而喻，提高棉花纖維品質(zhì)成為研究棉花的首要目的。隨著基因克隆技術(shù)的不斷改進(jìn)，大量的在棉纖維發(fā)育階段優(yōu)勢或特異表達(dá)的基因被克隆出來。本實驗挑選了7個已報道的棉纖維發(fā)育優(yōu)勢表達(dá)基因(GhACT1、GhCAD1、GhCCR1、GhExp1、GhExp2、GhCIPK1和GhPL)，首先利用實時熒光定量PCR技術(shù)，分析了以上7個基因分別在纖維品質(zhì)具有差異性的陸地棉、海島棉和亞洲棉的0D

2、PA、5DPA、10DPA、15DPA、20DPA、25DPA的相對表達(dá)量，明確基因表達(dá)規(guī)律，并探討基因表達(dá)量與纖維品質(zhì)的關(guān)系;其次對這些基因的蛋白質(zhì)理化性質(zhì)、亞細(xì)胞定位和N端信號肽、二級結(jié)構(gòu)等生物信息學(xué)進(jìn)行了預(yù)測分析。實時熒光定量PCR結(jié)果顯示7個基因均在纖維伸長期具有較高表達(dá)量，但是遺傳背景的不同，7個基因在三個棉花品種纖維發(fā)育時期的表達(dá)譜也有差異。通過對比GhExp1和GhExp2的相對表達(dá)量發(fā)現(xiàn)，GhExp1的表達(dá)量遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于Gh