全基因組外顯子高通量測序發(fā)現(xiàn)中國人群克羅恩病易感基因IFNAA4、IFNA10.pdf

1、背景: 克羅恩病的發(fā)生與遺傳因素密切相關(guān)，近年來在中國的發(fā)病率呈逐年上升趨勢，但對(duì)其發(fā)病機(jī)制的理解還十分有限?？肆_恩病的基因異質(zhì)性和種族差異十分突出，但中國人群特異性的易感基因尚未明確。
　　 目的: 本課題首次對(duì)中國克羅恩病病例進(jìn)行外顯子高通量測序，在全外顯子范圍內(nèi)尋找克羅恩病新的突變基因位點(diǎn)，探討易感基因位點(diǎn)與克羅恩病內(nèi)科藥物療效的關(guān)系，并利用體內(nèi)、體外實(shí)驗(yàn)對(duì)易感基因進(jìn)行功能驗(yàn)證，探索其致病機(jī)制。
　　 方法: 我們

2、對(duì)4例中國克羅恩病患者外周血樣本進(jìn)行全基因組外顯子高通量測序，篩選出共有突變位點(diǎn)，用Sanger測序方法對(duì)這4例患者標(biāo)本進(jìn)行測序驗(yàn)證，再通過擴(kuò)大樣本分析，篩選出在患者和健康對(duì)照中基因頻率有顯著性差異的位點(diǎn)，比較易感基因與內(nèi)科治療療效的關(guān)系。建立小鼠急性腸炎模型，明確易感基因不同亞型對(duì)腸道炎癥的作用;在患者血清標(biāo)本中，檢測突變型對(duì)蛋白表達(dá)量的影響;并探索易感基因是否介導(dǎo)調(diào)節(jié)性T(Treg)細(xì)胞等的活化與分化而參與黏膜炎癥反應(yīng)的機(jī)制。

3、>　　 結(jié)果: 我們通過外顯子組高通量測序和常規(guī)Sanger測序驗(yàn)證，篩選出26個(gè)共有基因的改變，并在較大樣本量克羅恩病例和對(duì)照組中，證明IFNA4和IFNA10亞型為本病高突變率的國人特異易感基因，并與內(nèi)科藥物療效顯著相關(guān);證明IFNA不同亞型對(duì)腸道黏膜炎癥有保護(hù)作用;雜合體突變型可影響IFNA4和IFNA10的蛋白質(zhì)表達(dá)量;IFNA4和IFNA10可介導(dǎo)Foxp3+Treg或CD4+CD25+Treg等細(xì)胞的分化與活化機(jī)制，參與腸