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文檔簡介
1、目的:采用基因芯片技術,對比鼻咽癌轉(zhuǎn)移組、非轉(zhuǎn)移組和鼻咽良性病變組鼻咽部組織之間的基因差異,篩選鼻咽癌轉(zhuǎn)移相關基因表達譜,探討鼻咽癌轉(zhuǎn)移機制。 方法:設立鼻咽癌轉(zhuǎn)移組為A組即實驗組,鼻咽癌非轉(zhuǎn)移組為B組即對照組,鼻咽良性病變組織為C組。分別抽提各組中每個樣本的RNA,鑒定質(zhì)量后,各組中每個樣本取等量RNA混合為一個樣本池,采用逆轉(zhuǎn)錄的方法,制成cDNA鏈,以兩種熒光Cy3和Cy5標記后作為探針,與SBC人16KcDNA表達譜芯片
2、進行雜交。用生物統(tǒng)計學及生物信息學方法分析它們之間的基因差異表達;并采用實時熒光定量PCR驗證基因芯片篩選結果。 結果:三組數(shù)據(jù)分析后顯示鼻咽癌轉(zhuǎn)移組和非轉(zhuǎn)移組之間有2倍共同差異表達的基因134個,其中上調(diào)基因107個,下調(diào)基因27個。涉及基因包括細胞粘附基因、細胞外基質(zhì)蛋白、細胞周期基因、細胞生長增殖基因、凋亡基因、轉(zhuǎn)錄因子及調(diào)控等。實時熒光定量PCR驗證FN1等6個基因,結果與基因芯片一致。 結論:用基因芯片技術篩選
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