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文檔簡介
1、目的:E-鈣粘蛋白(E-cadherin,CDH1)是鈣粘蛋白家族中的一個成員,與腫瘤侵襲轉移密切相關。該基因具有高度多態(tài)性,其啟動子區(qū)及非編碼區(qū)存在的多態(tài)性位點可通過調控基因轉錄或蛋白表達水平而影響腫瘤的發(fā)生和發(fā)展。本研究旨在探討該基因啟動子區(qū)-160C/A和-347G/GA單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)與中國北方人子宮頸鱗狀細胞癌(cervical cancer)的關系。
2、> 方法:采用基于醫(yī)院的病例.對照研究方法,收集243例腫瘤患者和323例健康對照個體的靜脈抗凝血5ml,同時記錄其病史、個人史、腫瘤家族史。以蛋白酶K消化-飽和氯化鈉鹽析法提取外周血白細胞DNA,采用聚合酶鏈反應-限制性片段長度多態(tài)性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)方法檢測CDH1基因的兩種多態(tài)性基因型。
3、r> 數據統(tǒng)計分析采用SPSS11.5版軟件包(SPSS Company,Chicago,Illinois,USA)進行,P<0.05認為有統(tǒng)計學意義。比較基因型頻率觀察值與預期值并用X2檢驗進行Hardy-Weinberg平衡分析。CDH1基因型及等位基因型分布在病例組與對照組中的分布比較采用行×列表X2檢驗。單體型頻率及連鎖不平衡分析采用EH軟件和2LD軟件(1.2version,Rockefeller University,
4、New York)。以非條件Logistic回歸法計算表示相對風險度的比值比(odds ratio,OR)及95%可信區(qū)間(confidence interval,CI)(年齡作校正)。
結果:
1對照組CDH1基因-160C/A、-347G/GA兩個多態(tài)性位點的基因型頻率分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P=0.80,P=0.38)。
2 CDH1基因-347G/GA多態(tài)3種基因型頻
5、率(G/G、G/GA、GA/GA)在子宮頸癌組和對照組中分別是46.5%、38.7%、14.8%和54.2%、39.3%、6.5%,兩組比較有顯著性差異(P=0.004);CDH1基因-347G/GA多態(tài)的等位基因頻率(G、GA)在子宮頸癌組和對照組中分別是65.8%、34.2%和73.8%、26.2%,子宮頸癌組的GA等位基因頻率(34.2%)明顯高于對照組(26.2%),兩組比較有統(tǒng)計學意義(P=0.004),與G等位基因比較,攜帶
6、GA等位基因可能增加子宮頸癌的發(fā)病風險(OR=2.66,95%CI=1.46~4.78)。與G/G基因型比較,攜帶GA等位基因的基因型(G/GA+GA/GA)有增加子宮頸癌的發(fā)病風險的趨勢,OR值為1.36(95%CI=0.97~1.89)。以臨床分型分層分析發(fā)現,攜帶GA等位基因的基因型(G/GA+GA/GA)可以明顯增加空洞型子宮頸癌的發(fā)病風險(OR=2.53,95%CI=1.00~6.38),以腫瘤大小分層分析發(fā)現,攜帶GA等位基
7、因的基因型(G/GA+GA/GA)有增加腫瘤直徑>6cm子宮頸癌的趨勢(OR=1.74,95%CI=0.96~3.16),與臨床分期及療效無關。
3 CDH1基因-160C/A多態(tài)的基因型和等位基因頻率在子宮頸癌組和對照組中分布無顯著性差異(P=0.31和P=0.15)。與C/C基因型比較,C/A+A/A基因型可能與子宮頸癌的發(fā)病風險無關(OR=1.25,95%CI=0.89~1.76)。以臨床分期分層分析發(fā)現,C/A+A
8、/A基因型有增加早期子宮頸癌的發(fā)病風險的趨勢(OR=1.45,95%CI=0.98~1.95)。以臨床分型、腫瘤大小和治療結束時療效評價分層分析,CDH1基因-160C/A多態(tài)的基因型頻率在各組間分布也均未發(fā)現顯著性差異(P值均大于0.05)。
4對CDH1基因-160C/A和-347G/GA兩個SNP位點進行聯合分析顯示,-160C/-347G單體型是人群中最常見的,占59.7%,4種單體型(-160C/-347G、-1
9、60C/-347GA、-160A/-347G和-160A/-347GA)頻率在子宮頸癌組與對照組中分布有顯著性差異(P=0.01)。另外發(fā)現,CDH1-160C等位基因和-347G等位基因存在連鎖不平衡現象(D’=0.79,SD=0.07)。
5 CDH1基因-347G/GA多態(tài)3種基因型頻率(G/G、G/GA、GA/GA)在子宮頸癌患者HPV16,18型感染陽性組和陰性組中分別是44.7%、39.2%、16.1%和61.
10、5%、34.6%、3.8%,分布無統(tǒng)計學意義(P=0.09);與G/G基因型比較,攜帶GA等位基因的基因型(G/GA+GA/GA)與HPV16.18型感染無關,OR值為1.98(95%CI=0.86~4.56)。
6 CDH1基因-160C/A多態(tài)的基因型在HPV-16、18型感染陽性組及陰性組中分布無顯著性差異(P=0.72)。與C/C基因型比較,C/A+A/A基因型可能與HPV-16、18型感染無關(OR=0.81,9
11、5%CI=0.39~1.84)。
結論:
1 CDH1基因-160C/A的基因多態(tài)性可能與宮頸癌的易感性無關。
2 攜帶CDH1基因-347GA等位基因的基因型可能增加宮頸癌的發(fā)病風險。
3 CDH1基因-160C/A和-347G/GA SNPs與HPV-16、18型的感染無關。
4 CDH1基因-160C/A和-347G/GA SNP位點存在明顯的連鎖關系。且-16
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