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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
1. 研究人乳頭瘤病毒(human papillomavirus,HPV)感染與食管癌(esophagealcarcinoma,EC)發(fā)生的相關(guān)性:檢測(cè)我國(guó)不同區(qū)域EC 患者癌組織中HPV 感染率及其型別,了解我國(guó)不同區(qū)域EC 組織中HPV 型別分布特性;檢測(cè)HPV16 E2/E6基因比率,分析EC 樣品中HPV16的整合狀態(tài);檢測(cè)HPV 整合在染色體的位置,以及通過(guò)對(duì)我國(guó)已發(fā)表的有關(guān)HPV 與EC相關(guān)文獻(xiàn)的Met
2、a分析,探討HPV 感染與我國(guó)EC發(fā)生的病因?qū)W關(guān)系。
2. 研究EB 病毒(Epstein-Barr virus,EBV)感染與胃癌發(fā)生的相關(guān)性:通過(guò)對(duì)PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)中的有關(guān)EB 病毒(Epstein-Barr virus,EBV)與胃癌相關(guān)文獻(xiàn)的Meta分析,探討EBV 感染與胃癌發(fā)生的相關(guān)性;構(gòu)建攜帶EBV 編碼BARF1基因的真核表達(dá)載體,為今后建立EBV 感染體外模型奠定基礎(chǔ),以便進(jìn)一步探討EBV 感染與胃癌發(fā)
3、生的病因?qū)W關(guān)系。
方法:
1. 應(yīng)用HPV L1基因區(qū)通用引物PGMY09/11和GP5+/6+,進(jìn)行巢式聚合酶鏈反應(yīng)(nested polymerase chain reaction,NPCR);應(yīng)用HPV(包括HPV16、HPV18)E6-E7基因保守區(qū)的簡(jiǎn)并引物,及HPV16 E6、HPV18 E6 型特異引物進(jìn)行巢式多重聚合酶鏈反應(yīng)(nested multiplex Polymerase chain
4、reaction,NMPCR),檢測(cè)EC組織中HPV16和HPV18兩型別;分析我國(guó)不同區(qū)域EC 標(biāo)本中HPV 感染狀況。
2. 應(yīng)用HPV16 E2和E6 引物進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光PCR 擴(kuò)增,檢測(cè)HPV16 E2 與E6的含量,通過(guò)E2 與E6的比率,確定HPV 整合狀態(tài);用β-actin 引物進(jìn)行熒光PCR 擴(kuò)增,檢測(cè)每一樣品中β-actin 含量,通過(guò)HPV16E6 與β-actin 之比,估算HPV16的病毒載量。
5、> 3. Oligo(dT)17-P3 引物反轉(zhuǎn)錄PCR 擴(kuò)增cDNA的第一鏈,HPV E7 特異P1 forward與P3 reverse 引物第一輪擴(kuò)增,HPV E7 特異P2 forward 與Oligo(dT)17-P3 reverse 引物第二輪擴(kuò)增,將第二輪產(chǎn)物連接到pMD-18T 載體,進(jìn)行測(cè)序分析,分析HPV 整合在人染色體的位置。
4. 確定文獻(xiàn)選擇與剔除標(biāo)準(zhǔn)后,以HPV和食管癌為關(guān)鍵詞,在國(guó)內(nèi)萬(wàn)方
6、網(wǎng)和中國(guó)知網(wǎng),檢索有關(guān)HPV 與食管癌相關(guān)的研究論文,依據(jù)Cochrane 系統(tǒng),按照Mantel–Haenszel方法,對(duì)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)作出異質(zhì)性檢驗(yàn),應(yīng)用隨即效應(yīng)模型,計(jì)算各項(xiàng)研究文獻(xiàn)中食管癌病例組和正常對(duì)照組中HPV的優(yōu)勢(shì)比(odds ratio,OR)、權(quán)重(weight)、95%可信區(qū)間(95%CI)及合并后的權(quán)重和95%CI。數(shù)據(jù)處理采用Review Manager 4.2 軟件完成,以P<0.05 為差異有顯著性。進(jìn)一步驗(yàn)證HP
7、V在我國(guó)食管癌發(fā)生中的病原學(xué)作用。
5. 確定文獻(xiàn)選擇與剔除標(biāo)準(zhǔn)后,以EBV和胃癌為關(guān)鍵詞,在PubMed 數(shù)據(jù)庫(kù)中,檢索有關(guān)EBV 與胃癌相關(guān)的研究論文,依據(jù)Cochrane 系統(tǒng),按照Mantel–Haenszel 方法,對(duì)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)作出異質(zhì)性檢驗(yàn),應(yīng)用隨機(jī)效應(yīng)模型,計(jì)算各項(xiàng)研究文獻(xiàn)中EBV相關(guān)胃癌與臨床病理特征的優(yōu)勢(shì)比(odds ratio,OR)、權(quán)重(weight)、95%可信區(qū)間(95%CI)及合并后的權(quán)重和95
8、%CI。數(shù)據(jù)處理采用Review Manager 4.2 軟件完成,以P<0.05 為差異有顯著性。進(jìn)一步驗(yàn)證EBV在胃癌發(fā)生中的病原學(xué)作用。
6. 根據(jù)GenBank 提供的cDNA 序列,設(shè)計(jì)特異性引物,構(gòu)建BARF1基因的真核表達(dá)載體。
結(jié)果:
1. 從收集的食管癌患者標(biāo)本中檢測(cè)HPV 感染的陽(yáng)性率:河南省林州市為93.2%(109/117);河北保定市為88.1%(37/42);四川省鹽
9、亭市為95%(19/20)。它們主要以HPV16 型出現(xiàn),其次是HPV18 型:HPV16 型陽(yáng)性率分別占59.6%(65/109)、51.4%(19/37)
和57.9%(11/19);HPV18 型分別占陽(yáng)性率的19.3%(21/109)、21.6%(8/37)和21.1%(4/19)。
2. 熒光PCR 結(jié)果顯示:32例HPV16E6 陽(yáng)性標(biāo)本中,檢測(cè)到6.3%(2/32)為純游離型、84.3%(27/
10、32)為游離/整合的混合型、9.4%(3/32)為完全整合型,說(shuō)明病毒DNA 與宿主基因組整合很普遍;這些標(biāo)本的病毒載量大約在0.066-65.2 拷貝/細(xì)胞之間。
3.序列分析結(jié)果顯示,有兩位HPV18 陽(yáng)性的食管癌患者,其HPV18 整合于患者5號(hào)染色體上。
4. 入選17 篇文獻(xiàn)食管癌組織標(biāo)本HPV 檢出率為44.0%,正常對(duì)照組織HPV 檢出率為16.7%,食管癌組織中HPV 感染率與正常對(duì)照組織相比
11、具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);
有12 篇文獻(xiàn)進(jìn)行了HPV16 型特異性檢測(cè),其結(jié)果顯示,食管癌組織標(biāo)本中HPV16 占38.6%,正常組織標(biāo)本中HPV16 占15.9%,HPV16 感染率與正常對(duì)照組織相比具有顯著性差異(P<0.05)。被檢標(biāo)本分布在河南、廣東、新疆、四川、河北、上海、福建和香港八個(gè)區(qū)域,其HPV 感染與地域分布存在顯著性差異(P<0.05)。
5. 22 篇入選文獻(xiàn)中收集的胃癌病例54
12、75例,檢測(cè)到EBV 陽(yáng)性病例411例。在EBV陽(yáng)性胃癌中,男性檢出率為11.1%,女性檢出率為3.0%;EBV 陽(yáng)性胃癌與陰性胃癌相比具有較少的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移;殘胃癌中EBV 感染率為28.3%;EBV 感染與組織學(xué)分型及標(biāo)本類型無(wú)顯著相關(guān)性(p>0.05)。
6. 以兩端添加酶切位點(diǎn)的特異性引物,進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,得到與預(yù)期目的基因片段大小相符的666bp的片段;克隆至載體后,經(jīng)雙酶切和測(cè)序分析,確認(rèn)BARF1基因已正確連
13、接到pcDNA3.1(+)-his 真核表達(dá)載體。
結(jié)論:
1. 河南省林州市、河北省保定市及四川省鹽亭市食管癌樣品中,HPV 檢出率分別為93.2%、88.1%和95.0%,平均陽(yáng)性率為92.2%;其中,HPV16和HPV18 兩型別平均檢出率分別為53.1%和18.4%,說(shuō)明HPV16和HPV18 兩型別在我國(guó)具有較高的分布頻率。提示HPV16和HPV18 兩型別可能在食管癌發(fā)生中具有普遍意義。
14、 2. HPV16 陽(yáng)性食管癌樣品中,病毒DNA 與宿主基因整合很普遍,提示HPV 感染可能是食管癌發(fā)生的重要病原因子。
3. 部分HPV18 可能整合在人5 號(hào)染色體,推測(cè)HPV基因組在宿主細(xì)胞染色體上整合后,形成HPV 持續(xù)性感染,是細(xì)胞轉(zhuǎn)化及癌變的關(guān)鍵。
4. Meta分析顯示,我國(guó)食管癌組織中HPV 感染與正常組織相比具有顯著性差異(p<0.05),并且高危型HPV 感染在不同地域普遍存在。這些結(jié)
15、果進(jìn)一步證實(shí)高危型HPV感染是食管癌發(fā)生的重要病原因子。
5. EBV 感染僅發(fā)生在癌組織細(xì)胞中,并且與患者性別、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、癌組織發(fā)生部位顯著相關(guān)(p<0.05),與患者癌組織學(xué)分型、標(biāo)本類型無(wú)顯著相關(guān)性(p>0.05);提示,EBV 陽(yáng)性胃癌具有獨(dú)特的臨床病理學(xué)特征,EBV 感染與部分胃癌的發(fā)生密切相關(guān)。
6. 成功地構(gòu)建了真核表達(dá)載體pcDNA3.1(+)/BARF1-his,為今后建立EBV相關(guān)胃癌研
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