16833.轉(zhuǎn)分化過程中microrna表達(dá)的研究_第1頁
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1、中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所博士后研究工作報(bào)告AnalysisofmicroRNAexpressionduringtransdifferentitationMonikaHeiner工作完成時(shí)間2Q!至生至Q旦2Q旦報(bào)告提交時(shí)間2Q至2生至Q旦至Q旦AbstractRecently,severaIstudieshavedemonstratedthatterminallydifierentiatedsomaticc

2、ellscanbedirectlyconvertedintoothercelltypesbytheexpressionofdefinedfactorsExamplesofthistransdifferentiationincludesconversionofdifferentiatedcellsintoneurons,cardiomyocytes,bloodprogenitorcells,hepatocytes,andepiblasts

3、temcells(HanetaL,2011:HuangetaL,2011;ledaetaL,2010:Sekiya&Suzuki,2011;SzaboetaL,2010:Vierbuchen&Wernig,2012)Mousefibroblastcellsforinstancecanbeconvertedtofunctionalhepatocyte—likecellsbythetransductionofthreetranscripti

4、onfactors(Huangeta1,2011)Improvingtheefficiencyoftheconversion,however,especiallywithregardtopotentialclinicalapplicationsisstillamajorconcernInthisstudy,wewanttoanalyzemicroRNAexpressionprofilesduringtransdifferentiatio

5、nofmousefibroblastcellsbynext—generationsequencingInthissystemweexpecltogainnewinsightsonhowmicroRNAsareregulatedsincemicroRNAscanbeconsideredkeyplayersinmanybiologicalprocessessuchascellcyclecontrol,cellgrowthanddiffere

6、ntiation,metabolism,apoptosis,andembryodevelopment(Bartel,2009)Furthermore,recentresultssuggestthatbesidestranscriptionfactors,expressionofmicroRNAsalonecandirectlyconvertcelltypes(JayawardenaetaL,2012:MiyoshietaL,2011:Y

7、ooetaL,2011)MicroRNAexpressionprofilingmayalsoprovideUSwithabetterunderstandingoftheprocessofdirectconversionofcelltypeswiththeemphasisonimprovingefficiencyMicroRNAexpressionanalysiswasdoneontheIlluminaGenomeAnalyzerwith

8、totalRNAisolatedfrommousetail—tipfibroblastsTTF),inducedhepatocyte1ikecells(iHep),andprimaryhepatocytes(pHep)SeveraldifferentiallyexpressedmicroRNAswerevalidatedbyquantitativerealtimeRT—PCRAmongtheup—regulatedmicroRNAsin

9、iHepcellswastheliverspecificmiR122whichaccountsformorethan70%ofallmicroRNAsinadultliverSeveralothermicroRNAsaresignificantlydownregulatedafterconversiontoiHepcellsWevalidateddownregulationofmiR34family,miR143/145,miR199a

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