28897.不同外源擾動因素對腸道菌群組成結(jié)構(gòu)影響的研究

1、上海交通大學(xué)博士學(xué)位論文不同外源擾動因素對腸道菌群組成結(jié)構(gòu)影響的研究姓名：魏華申請學(xué)位級別：博士專業(yè)：微生物學(xué)指導(dǎo)教師：趙立平20081001摘要第3，5，9周大鼠的新鮮糞便樣本，應(yīng)用優(yōu)勢細(xì)菌(16SrRNA基因的V3區(qū))PCRDGGE以及擬桿菌、柔嫩梭菌、乳酸菌和雙歧桿菌的類群特異性PCRDGGE方法結(jié)合多變量統(tǒng)計(jì)分析包括主成分分析(Principalcomponentanalysis，PCA)與最小偏二乘判別分析(Partialle

2、astsquaresdiscriminantanalysis，PLSDA)，對大鼠的腸道菌群組成進(jìn)行動態(tài)分析。分析結(jié)果顯示，單純二甲肼誘導(dǎo)組大鼠的腸道優(yōu)勢細(xì)菌與柔嫩梭菌的組成在實(shí)驗(yàn)第3周與健康對照組沒有明顯差異，在實(shí)驗(yàn)第5周與健康對照組具有差異趨勢，而在實(shí)驗(yàn)第9周，當(dāng)單純二甲肼誘導(dǎo)大鼠形成(37726)個異常隱窩病灶(Aberrantcryptfoci，ACF)／全結(jié)腸時，其腸道優(yōu)勢細(xì)菌與柔嫩梭菌的組成與未見明顯ACF的健康對照組具有明

3、顯差異，Martens’uncertaintytest結(jié)合ANOVA檢驗(yàn)◇O05)結(jié)果提示優(yōu)勢細(xì)菌中的2條PCRDGGE條帶與柔嫩梭菌的5條PCRDGGE條帶是區(qū)分第9周2組動物腸道菌群的重要PCRDGGE條帶，將這些條帶進(jìn)行割膠測序，這些條帶為Ruminococcusobeum與Allobaculumstercoricanis等的類似菌。針對部分差異序列設(shè)計(jì)特異引物，熒光定量PCR的結(jié)果證實(shí)，實(shí)驗(yàn)9周，單純二甲肼誘導(dǎo)組大鼠的腸道Rum

4、inococcusobeum與Allobaculumstercoricanis的類似菌數(shù)量明顯高于健康對照組，差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，與PCRDGGE結(jié)果相符。單純二甲肼誘導(dǎo)組大鼠腸道中乳酸菌和雙歧桿菌的組成沒有發(fā)生明顯改變，其雙歧桿菌數(shù)量也沒有明顯改變。本研究結(jié)果提示，與健康對照組相比，動態(tài)監(jiān)控疾病高危動物或人群的腸道菌群組成可能會成為一種無損傷性的評估宿主健康狀態(tài)的方法，腸道菌群組成偏離健康群體的動物，其機(jī)體的健康狀態(tài)可能也發(fā)生了改變。